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山本内心十分难过，无可奈何地批准了这份电文。
6月5日2时55分，山本向所属部队下达了联合舰队第161号作战命令：
1。 撤销占领中途岛的作战计划。
2。 主力部队负责集合进攻部队和机动部队（“飞龙”号及其护航舰只除外），并于6月6日上午在北纬33度、东经170度的位置加油。
3。 警戒部队、“飞龙”号及其护航舰只以及“日进”号也应驶向上述位置。
4。 登陆部队向西行驶，脱离中途岛飞机的攻击范围。
作出上述决定后，山本的主力部队就开始向东航行，去与南云和近藤会合。
当近藤按时到达后，南云却仍无踪影。于是，山本派出“凤翔”号的一架搜索机去寻找机动部队的下落。
其实，南云一直与近藤保持着平行航行，并逐渐向指定位置靠拢。
12时零5分，日军的几支部队在山本规定的海域会合。
然而，这根本不是各舰队所期待的胜利和欢乐的大会师。日本4艘最精良的航空母舰已不复存在，日方还损失了332架飞机。
更惨的是， 2197名技术优秀、富有实战经验的作战人员在战斗中丧生。其中：“赤城”号上263人，“飞龙”号上416人，“苍龙”号上718人，“加贺”号上约800人。
在南云新的旗舰上，军官们面对这种作战结局，都感到颜面丢尽，无地自容！
草鹿不动声色地坐在“长良”号病员舱里，一个卫生兵正替他治疗烧伤。这时，首席参谋小石走上前来，沉痛地说：“所有参谋人员都决心以自杀来为中途岛战败赎罪。请敦促司令长官也下决心这样做吧！”
当草鹿看见几艘航空母舰相继都起火燃烧时，也曾觉得一切都完了。回日本后，他将以何脸面面对江山，面对天皇家族，面对同胞？但经过反复思考后，他改变了自己的想法。他发誓说：“我决不就此罢休。现在还活着的人和死者的英灵都应当站起来保卫国家。仗还要继续打下去，绝不能以死来解脱！”所以，此时小石前来说服草鹿的确来的不是时候。
最后一幕（4）
只见草鹿两眼冒火，狠狠地把小石训了一顿，然后命令小石把南云的全体参谋人员找来。
参谋们到齐之后，草鹿异常激动地阐述了自己的看法。他非常明确地说：“我反对自杀。你们一个个都像疯婆娘。”他大声地说着，话音里充满了鄙弃。“当初你们轻取小胜就无比激动，现在一打败仗就慷慨激昂地要去自杀。对大日本来说，现在还不是你们说这种话的时候。你们为什么不想想怎样通过自己的努力去扭转局面，反败为胜呢？我坚决反对自杀。我将把自己的意见报告给司令长官。”
受了这番训斥后，机动部队参谋人员要求剖腹自杀的议论销声匿迹了。
草鹿在伤口包扎好之后，径直走到南云的舱室。他发现自己的上司愁眉苦脸、情绪低沉。草鹿把自杀将于事无补的看法反复作了说明，最后语重心长地对南云说：“日本需要我们继续战斗下去！”
南云悉心静听后说道：“我非常赞赏你的意见。但你必须明白，司令官所做的事并非都要合乎情理。”
草鹿反问道：“司令官，失败主义情绪于事又有何益呢？”
南云无可奈何地说：“好吧，我决不鲁莽行事。”
看到南云的脸上浮现出一缕释重的表情，草鹿知道自己的话起了作用，才从南云的房间走了出来。
战斗还没有完全结束，美国的“约克城”号航空母舰还要遭到劫难。
6月5日清晨，日本“伊－168”号潜艇艇长田边弥八少校收到一份来自联合舰队司令长官和第6舰队司令长官的特急电：“我空袭使敌一艘‘企业’级大型航空母舰遭重创，现正漂浮在中途岛东北方向150海里的洋面上。令‘伊－168’火速追踪，将其击沉。”
从译电官对无线电的监听中，田边对中途岛战役的整个战况已经有了比较清楚的了解。他知道日本已丧失了攻占中途岛的战机。
为了不影响士气，田边并没有把监听到的内容以及他个人的看法向艇员们透露。
这项命令给了田边一次求之不得的机会，使他能替遭受损失的日本航空母舰报仇雪耻。他立即把刚收到的命令传达到艇上全体官兵。
听了田边传达的命令后，艇上有些人高兴得欢呼起来，但也有些人因心情紧张而颤抖起来。
田边在军官###室召集参谋人员，指示他们拿出一份详细的攻击方案。
随后，他自己返回驾驶台，坐在小板凳上，认真地考虑着他是否能发现并捕捉到这艘航空母舰，以及如何才能击沉它。
田边估计，在受损的航空母舰四周，一定有严密的警戒。航空母舰四周不仅会有驱逐舰护卫，而且还会有飞机在空中巡逻。因此，他可能无法进入击沉敌舰的阵位。
田边两眼凹陷，目光深沉，身材瘦削，举止优雅。他在驾驶台连续坐了几个小时，考虑解决问题的办法。他没有太多的创造才能，但却具备了一个潜艇艇长的某些可贵之处——他像一只潜猎老鼠的猫那样，具有无限的耐心。
田边反复思考，他在考虑如何才能在最有利的时间发现和攻击目标。他认为，如果在拂晓时找到那艘航空母舰，是最为有利的。
当时，日本潜艇上还没有装备雷达，田边所依靠的就是自己的目力以及他那副性能良好的12厘米双筒望远镜。为了能看清猎物，他需要一点亮光，但为了不使自己的潜艇被发现，天又不能太亮。因此，拂晓是接近敌舰的最佳时机。
夜幕徐徐降临。田边下到舱里去巡查，惊异地发现有些艇员已进入了梦乡，他们头上缠着头巾，做好了充分的作战准备。另一些人则激动得无法入睡，正聚在一起快活地聊天。
田边乘夜色朦胧，把潜艇浮出水面，以16节的航速在水面上朝着目标航行。
在潜艇上，一名监视哨兵用望远镜警惕地观察着东方的海面。
4时10分，监视哨兵突然大喊：“右舷前方发现一个黑点！”田边立即来到哨位上亲自观察。他透过望远镜凝视着逐渐变得明亮起来的天边，心里十分喜悦。
最后一幕（5）
猎物就在大约2万米开外，而且发现它的时机和它所处的位置对潜艇的攻击十分有利。
潜艇从西南方迎着冉冉升起的旭日航行，艇员们可以清楚地看见“约克城”号。只要田边不暴露自己，敌人要发现位于夜色尚未退尽方向的潜艇是有困难的。田边立即命令把航速从16节减到12节，以减弱潜艇航行时激起的浪花。
大约在6时左右，田边看见有两艘美军的驱逐舰正在严密地守护着航空母舰。于是，他命令潜艇下潜，仅以3节的航速悄然向前。
管理员把战斗给养分配到每个艇员。鱼雷兵把鱼雷最后再擦拭一遍。
距离越来越近了。田边数了数，共有6艘军舰和1艘扫雷艇，在离航空母舰约1000米处成两列环绕。
田边知道，由于敌人担任掩护的驱逐舰数量众多，加之海面平静，潜望镜很容易被发现。于是他命令收起潜望镜，靠听声音在水下航行。
一开始，田边每隔10分钟升起一次潜望镜观察海面，后来改为大约每隔1小时才升起一次潜望镜。当接近至目标约万米时，他再次冒险升起潜望镜观察。
他从潜望镜中观察到，美军驱逐舰高度戒备着。而且田边从噪声中判断出，敌人使用了声纳。
“准备对付敌人深水炸弹攻击！”田边下达了战斗指令。
艇员们立即执行指令，做好对付深水炸弹的准备后屏住气静静地等候着。
这时，东风徐起，吹起了层层细浪。这对“伊－168”的隐蔽接敌是有利的。
田边随后又进行了几次潜望镜观察，但所看到的情况使他疑惑不解。虽然那艘航空母舰已基本静止不动，可它的位置却与潜艇领航员的计算不符。田边经过一次又一次的努力，他与航空母舰的相对位置不但没有改善，反而越来越糟了。敌航空母舰的航速有多大？平均航向是什么？是否正随风漂移？这些疑问田边都难以解开。
田边原想从航空母舰的左侧实施攻击，但由于航空母舰的运动，田边又决定改为攻其右舷，并相应地变动了潜艇的位置。但经过几次变换位置都不理想。
此时，美国的几艘驱逐舰不断从“伊…168”上方开过，田边更加提心吊胆。潜艇的乘员也都听到了美国人声纳装置的噪音。
9时37分，田边轻声祈祷后，又一次升起了潜望镜。潜望镜呈现出来的景象使他吃了一惊。因为航空母舰的庞大身躯就像一座山一样，矗立在他面前，连舰上美国官兵的一个个面孔他都看得清清楚楚。
他距离“约克城”号大约只有500米，已经深入到美军驱逐舰的警戒圈以内了。
田边急忙收起潜望镜，那速度比他刚才升起它的时候快得多了。
靠得太近，使田边不仅感到不自在，而且担心由于太近会使鱼雷攻击归于失败。因为距离太近，已经调定深度的鱼雷会从航空母舰下面钻过去。
此时，田边最担心的是美国的驱逐舰警戒圈。他知道，面临敌人如此高度的戒备，自己的攻击机会将只有一次，他必须首发歼敌。
为了确保首发命中，田边只好硬着头皮再次穿过两道驱逐舰警戒线，把潜艇与目标的距离增加一倍。
正当田边小心翼翼地向攻击距离运动时，他突然发现敌人的声纳探测声全部消失。他对这一奇怪现象感到不解，便向领航员问道：“是不是敌人的声纳值班人员都去吃午饭了？”
不论是什么原因，这个出乎意料的空子给了田边一次机会。他再度冒险升起潜望镜观察，发现自己在距航空母舰900米的最理想的距离上。而且，航空母舰正朝着他转身。这样，他正好面对舰体中部，“约克城”号的整个侧面恰在他的瞄准器中央。他在