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如同日俄战争对日本海军的发展起了强刺激作用一样，日本海大海战也使高野五十六这个刚开始其一生血火历程的少尉赢得了其在海军发展中所需要的“资历”，实现了自己多年为天皇献身的理想。为表彰高野五十六作战勇敢，1906年4月豆日，天皇授予他六等功勋旭日章，并颁发奖金350日元。这段经历对他是如此重要，以致其在后来曾专门撰文写道
日俄战争两年后，高野五十六升任中尉，再过两年，升任大尉，成为训练舰队宗谷分队的指导官，负责来舰上进行远洋实习的少尉候补生的业务指导。随舰远航到中国的珠江口和广州湾一带，并到过北美、澳大利亚。其时“宗谷”舰舰长是铃木贯太郎。铃木也毕业于江田岛海军兵学校，曾参加过侵略中国的甲午战争，后升任大将，并担任过日本海军中最高荣誉地位的海军军令部部长和内阁大臣。高野五十六由于和野村贞少将的关系，与铃木相处融洽。野村贞是高野五十六的堂兄，在明治年间是唯一一位长冈出身的海军舰长。在侵略中国的甲午战争中，因其指挥的“高千穗”号战舰战功突出，与“浪速”号的东乡平八郎并称“日本海军之双壁”，对后来日本海军军官影响颇大。铃木作为少尉候补生实习航海时，曾得到野村贞的指导，因而对野村贞非常尊敬。据铃木的回忆，此时的高野五十六最引人注目的是其深思熟虑而果敢行动的性格。平常沉默寡言，认真指导候补生，默默地履行分队长的职务。在指导官开会时也很少发言，但一旦开口，即观点明确，坚持己见，每每都不得不采用其意见。
转年，即1910年12月1日，高野五十六被海军大学录取为乙种学生。在第一次世界大战爆发的1914年，他再次来到海军大学，被录取为甲种学生。
海军大学创立于1888年，是一所主要培养日本将校级军官的高等学校。学生最初分为甲乙丙3种，甲种主要是大尉，修舰炮。水雷、航海等高等学科，乙种主要是校官或大尉，可选修任意学科，丙种主要是少尉。前两类学生学习期限是1年，后者为半年。1890年进一步修改条例，学生种类改为将校科甲种学生。将校科乙种学生、机关科学生和选科学生。将校科甲种学生是有2年以上海上经历，且身体健康、业务成绩优异、富于敏锐的判断力、将来有充分发展才能，经所属长官推荐的海军大尉。将校科乙种学生是有海上经历1年以上者，主要学习舰炮、水雷和航海。高野五十六先后经过了乙种、甲种学习，度过了其在海军大学的学习生活，并在1915年被授予四等瑞宝勋章，晋升海军少佐，由此奠定了其在日本海军中发展的基础。
年轻的高野五十六在日本海军中良好的发展趋势，引起了故乡长冈人的注意。一些旧封建残余分子似乎从高野五十六的身上看到了振兴长冈藩的希望，于是筹划了高野五十六改姓的活动，以让高野五十六继承长冈武士名门山本家的遗业。
山本家族历代任长冈藩的家老，食禄1300石，是长冈武士的总头领。尽管封禄只有120石的高野家与之相差甚远，但长期以来，两个家族交往颇深，尤其是精通古典和汉学的高野家，更为山本家所倚重。至山本带刀这一代时，日本发生了明治维新。在戊辰战争中，当长冈城被政府军攻克、长冈武士头领身负重伤不能指挥战斗时，23岁的山本带刀担起了长冈藩武士总司令的职务，率领全藩武士越80里转战于会津平原，与政府军周旋。后在若松城南边的饭寺村因大雾迷失方向，而陷入政府军的包围。本来政府军想劝其投降，但山本带刀武士忠勇思想十分浓厚，宁死不降
由于明治维新的不彻底性，明治政府本身也保留了浓厚的封建残余。不仅在人员组成上大部分是旧武士出身，而且在思想上也与旧的封建意识保持着千丝万缕的联系。因此明治政府在稳定了其统治之后，为了利用旧的封建“忠”、“勇”思想和武士道精神，便对响应落主号令参加戊辰战争叛乱的各旧藩武士作了宽大处理。1884年2月，特颁布法令准许山本家名再兴，接着在1889年，明治政府为庆祝颁布明治宪法而实行大赦，山本带刀被免去叛国罪名，远嫁他乡的山本带刀的长女再度继承家业。尽管如此，在实行长子继承制的日本，山本家族仍然是后继无人。这使得长冈的旧武士心中难以释怀。
为了发扬长冈藩风，使长冈名门山本家后继有人，长冈旧武士以旧藩主牧野忠笃为首，很早就开始在长冈武士的后代中寻觅能够不辱“山本”名誉的人。到1915年，随着高野五十六少佐即将从海军大学毕业，他们看到了希望。因为除了高野本人是一名很有前途的海军军官而外，他还是与山本家的中兴之祖山本老于齐结为刎颈之交的高野荣轩的子孙，继承山本衣钵者几乎非他莫属。藩主牧野为恳请高野五十六再兴山本家，绞尽了脑汁，付出了异常的努力，并动员曾担任高野家长老的田中浪江、山本家的旧臣渡边廉吉等人一同来做高野的工作。
此时的山本家，经过明治维新的冲击，庞大的家产早已被政府没收而消散，作为可继承的财产只有一套褪了色的破旧麻质武士礼服和位于长冈市稽古町长兴寺的山本家荒凉的墓地。然而聪明的高野五十六并没有计较这些，他考虑到自古以来高野家和山本家历代的关系，更重要的是，满脑子充斥着武士道思想的高野五十六，认识到继承山本遗魂，对其将来的发展会产生不可估量的作用。因为它符合日本近代天皇制利用封建残余加强统治、对外实行扩张侵略的需要，以他的话来说，就是继承长冈第一名门是长冈藩士的天命所在。几经考虑，他答应了牧野的请求。
1916年5月19日，经过精心准备，选择了长冈藩最有纪念意义的长冈城落成纪念日，举行了高野五十六改姓山本的仪式。在其五哥高野季八主持证明下，高野五十六作为山本家的后嗣，改名为山本五十六。
改名后，山本五十六所作的第一件事是在藩士们的簇拥下，厚祭山本家历代祖先，清理自戊辰战争以来已经荒废了50多年的山本家墓地；接着他又修心静身，于当日用了一个通宵将山本家祖先自庆长以来的各代法号、戒名全部书写了一份，并于第二天在长兴寺大作法事道场，以资纪念招魂。
改姓之后，山本五十六这个长冈武士的后代无形中又增加了一种荣耀，长冈遗魂以及一些旧武士倡导的军国主义色彩极浓的“长冈精神”、“常在战场”的遗训，刺激着他为了不辱山本名门之“声誉”更加竭尽全力，勤学苦练，忠于职守。
在山本五十六武士战袍加身后的第二年，即1918年，35岁的山本五十六与三桥礼子结婚。
三桥礼子出生于会津若松的一个士族家庭，以经营农业兼养奶牛、经售牛奶为生，其父三桥康守在明治维新后专营畜牧业，曾去过朝鲜。这样一个普通的家庭何以引得山本动心呢？据山本的知己好友堀悌吉说，山本在去相亲前后，曾给在长冈的家兄写过信，信中说
信中还写道
另一个使山本动心的理由，是礼子出生于会津若松。若松这个地方，在明治戊辰战争时，是流下长冈武士鲜血的地方。山本的父亲贞吉、大哥让、二哥登均在此作战负伤，非但如此，山本的养祖父山本带刀也是在此被斩的。山本第一次到若松同礼子见面的时候，特意参拜了饭寺村安葬着山本带刀等人的“无名英雄之墓”和若松市内为供奉在会津平原阵亡的长冈藩官兵而设立的阿弥陀寺。可以说山本的婚姻也带着浓厚的“武士道”味。
1918年8月31日，山本在水交社（日本海军俱乐部）举行了婚礼仪式，正式与三桥礼子完婚。崭露头角的山本五十六至此已在日本海军站稳脚跟，至于其后是如何求得进一步发展的，且听下章分说。
第三章 海外游历
海军大将佐藤写道
在会议期间，山本紧张地为代表团做一些具体的事务性工作，经常是通宵达旦地工作。尤其是在最后撰写报告书的时候，精力旺盛的山本连续3天3夜没有睡觉，其精力之充沛，工作准备之充分令代表团成员十分吃惊。当时任驻美大使的币原喜重郎曾说他是“一个不可思议的人”，不管如何熬夜都毫无倦色，而且还屡屡提出一些中肯的意见。连谈判的对手美国副国务卿戴维斯都称赞他是一个“了不起的家伙”。
经过各方面的充分准备，1921年7月，美国正式向英、日、中、法、意等国发出邀请，在华盛顿召开讨论限制军备及远东太平洋问题的会议。虽然山本五十六没有参加会议，但此次会议对一战后日本海军及山本五十六本人的发展却密切相关。
华盛顿会议于1921年11月12日在大陆纪念堂开幕。参加会议的日本首席全权代表是海军大臣加藤友三郎。大会选举美国首席代表美国务卿休斯为大会主席。休斯以主席身份致词之后，首先提出了美国关于限制海军军备的方案。美国方案的主要内容有
尽管山本五十六国提前回国未能参加正式的华盛顿会议，但由干他参加了会议的筹备，加之他的最要好的知心朋友堀悌吉是会议代表团的成员，因而对会议的情况还是十分了解的。事实上，日本接受3
但这一选择却遭到日本海军内强硬派的反对。以海军专门委员身份列席华盛顿会议的加藤宽治，回国后发表了坚决反对会议决议的观点，得到了海军中少壮派的支持，并引起了不明真相的一般日本国民的共鸣。从此，日本海军内形成了所谓的反对裁军条约的“舰队派”和与之相反的“条约派”。
务实而不轻易表态的山本，虽然从立场上是赞同条约派的观点，或者勿宁说他本人就是条约派的一员，但不可忘记的是，他又是一位彻头彻尾