结果，树倒蝴狲散，诺大的总统府就只剩下了总统楚爱春和国防部长蔡义武，当然还有第1师师长刘玉杰等几个蔡义武手下的嫡系军官还在维持台南的“秩序”。
6月9日，当蔡义武准备和美国人联系未尽事宜的时候，却发现昨天下午还在电话里信誓旦旦表示~将帮助蔡义武逃亡美国的M·道格拉斯中将——在前天晚上就已经和宣布“完成和平使命”的第7舰队副司令卡杰·约翰逊中将一起飞往了日本，整个“太平洋战区前进指挥部”里面就只剩下了三十几个文职和后勤人员正在打包裹准备回国。
当第一旅旅长王贸丰上校告诉楚爱春电视广播里面正在公布台北方面的讲话要求台南方面立即就地驻守，不得破坏公共财产，等待政府接收的新闻的时候，蔡义武是再也忍受不了折磨空通一声就倒了下去，忙得刘玉杰等人是手忙脚乱，又是掐人中，又是泼水，好不容易救醒了以后呢，外面又传来消息，花莲、高雄、台东等都已经“易帜”并宣布“正式地和叛乱分子楚爱春脱离一切关系”。
楚爱春是又惊有气又悔，惊的是大陆的能力太强了，自己的老师和领路人陈水扁教授的知识是一点都没有用上就失败了；气的是美国人、日本人就在发动前许下的正式参战，援助什么的还没有看见就冒泡了，想动用在美国人那里的存款吧，却被告之现在那是中国政府的钱——；悔的是陈水扁这个死Y的让自己坐台前来，当时没料到是这结果还以为捡到宝呢，现在呢，要钱没有难道上日本找陈水扁要饭吃吗？
看看剩下的这几个，要么是蔡义武这个“起义首功”人员，要么是在“起义首功”中立下汗马功劳的刘玉杰、王贸丰，都是些和自己一样被人当枪使的穷光蛋，真正他妈有钱的和主谋早就跑了，叹口气，却也想起来台南监狱里面还有一些自己的“保命符”——那些被关押的国民党和兰营人士啊，可总得有人牵线啊。
一合计，楚爱春和蔡义武亲自出马到高雄去请没参加叛乱的谢长廷，再由他出面去和民进党前主席许信良联系商量一下，看看是有办法没有。
在家里等了许久——内心里不知道骂了多少次蠢猪的谢长廷终于按捺不住了，听介绍完情况就满口答应，亲自电话请求许信良老先生——看在老前辈的份上一定要拉民进党一把，不是还有我和很多民进党员都没有参加叛乱吗，以前是那些狗崽子不好啊，您老人家一定要原谅，总不能眼看着没犯错误的民进党员也一起被解散吧？
三转两转下来，知道其中厉害关系的许信良也就立即转告台北，经过紧急磋商的台北询问秦总如何处置，当然，马先生也想知道北京的想法。深黯此道的秦总含笑回答了一句经典，“在双方关系没有正式敲定以前，我们不会也不应该参与台湾内部的事物。不过，我个人认为，目前的一切工作都应围绕最大限度地减少台湾人民的损失和牺牲来做。”
想想也对，马先生传递给楚爱春和蔡义武的消息是这样的，“在政府军正式接管以前，原驻扎部队应该继续维持秩序，释放非法关押者、保护公共和私人财产，逮捕和拘留恶意犯有攻击和抢劫等严重刑事罪行的犯罪分子，最大限度地减轻罪责”。当然——~最后执行命令还是比较彻底的楚爱春、蔡义武等人在1年后的2010年9月获得了特赦。
台北同时命令所有部队迅速向南开进，接管一切叛乱分子控制的地区并命令叛乱军队先行逮捕和控制一切“黑名单”上的人物，特别是牛彩人等台南“血腥之夜”的骨干分子。
到6月20日，美国人地面部队均已按照协定撤离，至6月24日，美国剩余的军事人员和驻台南的人员全部撤退，当然，顺便，美国人也悄悄地带离了部分人员。到6月25日，北军已全部控制南部局势，叛乱军队被全体解散，没有追究未参与阴谋的军官。
6月14日，经北京、台北、香港三地120名法律专家40余天的讨论和研究，《中华人民共和国台湾特别行政区基本法（临时）》、《中华人民共和国台湾特别行政区组织法》及相关部分法律文件被紧急提交人大审议，特别时期特别处理嘛，6月19日上述7个法律文件获得人大通过并被宣布即日起施行。
《中华人民共和国台湾特别行政区基本法（临时）》规定，中华人民共和国台湾特别行政区辖区包括澎湖及附属全部岛屿，施行与香港类似的高度自治。行政事务上设行政长官一人，下设财政署、警察署、检察署、民政署、教育署等14个机构；岛内按特区、县市设置两级立法会，年满18周岁未被剥夺选举权之台湾居民每4年将同时选举两级立法会议员；另置高等法院作为台湾特别行政区普通民事、刑事终审机构，下置市、县法院及区乡镇之初等法庭。
在2010年11月30日前举行第一届立法会和特别行政区首任行政长官普选，在此之前现有未参与叛乱之立法院成员在宣誓效忠《中华人民共和国台湾特别行政区基本法（临时）》后即可成为台湾特区临时立法会成员，负责在第一次选举前甄别、清理现有法律条文。在正式选举前未与《中华人民共和国台湾特别行政区基本法（临时）》冲突的法律文件继续有效。
现有的行政、司法架构在2010年选举前继续执行公务，履行自己的职责。马英九将继续担任台湾地区领导人并负责对现有的行政机构进行改革，一直到正式选举后卸职。
北军22万人将在正式选举前复员，陆军保留7万人编制转为新成立的特别行政区内卫警察部队，下设海岸警备队，宪兵、空骑警备队，负责台湾本地治安、反暴、稽私等，归属行政长官指挥，内卫警察部队总监由行政长官提名经立法会同意报北京总参谋部备案。
解放军将成立台湾军区，驻所台北，正式接管北军现有空、海军设施，划租原台北、基隆、花莲的海军基地及6个空军基地，附属岛礁也由海军全部接管，全部上岛三军官兵在和平时期将不超过4万人。驻军不会参与当地行政、司法等内部事物。
外交部将也派驻台特派员并参照驻港模式施行。
幸运的原广州军区副司令韩亭江中将、外交部非洲司司长何国拄最终获得了一百七十多人参与争夺的殊荣。
2009年7月1日。
这是一个亿万华夏儿女翘首盼望了60年的日子。
60年的渴望终于实现了，继1997年香港特别行政区成立以来从来没有任何的时候可以与今天相媲美，今天，就在今天，此时此刻的台北已经成为一个鲜花和旗帜的海洋，街道上猎猎飘扬的有五星红旗，八一军旗，当然多数还是未来红底梅花的区旗，连3天前才最后定稿的内卫警察部队的军旗——兰底红星也被“见利忘义”的商人们连夜赶造了出来。不过，仅仅是旗帜已经难以表达内心的激动和期盼。
90万市民不顾警告将可能出现的高温天气预报纷纷走出家门——拥挤在台北的街头巷尾，陆续赶来观摩特别行政区临时政府成立仪式的岛内各地代表和包括香港、澳门特区政府及国内31个省市在内派遣的代表则聚集在凯兰格林大道上~欢呼着、雀跃着、等待着这个庄严时刻的到来。
170多个国家和地区政府派遣的代表也纷纷汇集于广场上的原总统府门前被临时隔离出来的黄线内，2000多名嘉宾聚集在一起就把原本比较开阔的地方显得异常的拥挤。
新组建的特区内卫警察部队从本部小伙子中间挑选出了400名精英穿着兰色的崭新制服，手持04式小口径自动步枪再配上白色手套和标记着“中华人民共和国台湾特别行政区内卫警察部队宪兵第1团”繁体字样那兰白相间的徽章显得是格外精神，8点就早早地整齐列队站在了白线上，引得场外不少少女们的阵阵高声尖叫，对此很不满意的本地男孩子们也纷纷以“嘘”声来抗议宪兵们的潇洒。
不过，当解放军台北军区仪帐队8点20分准时出场后立马就让内卫部队失色不少，近百万双围观的目光也被吸引了过去。
他们是秦总谢绝北京国宾仪帐队支援的好意后亲自命令从27和38军士兵中临时挑选出来的，统一都是1。8米的个头，一色的关东大汉，新换装的09式礼服和台北的小伙子们一样地吸引着观众们的眼球，但是同样的制式小口径自动步枪在他们手上可就神气多了，三棱刺重新粉刷一下配在枪尖上是寒光闪闪在鲜花从中彰显出一分肃穆来。
散布在旁边的1600多名记者和摄影师纷纷抢占白线内比较好的位置进行拍摄，让本地居民只能远远地高举着相机大声抗议组委会偏心。
8点45分，现任台湾特别行政区政务署长宋楚喻和台湾特别行政区临时行政长官办公厅主任刘前义礼貌地相互致意后干脆一起走上观礼台，原本喧闹的凯兰格林大道立即平静了下来全部注视着。
8点50分，主席、委员长、总理及国民党前主席连战在临时政府首长、立法会主席，首席高等法官的陪同下进场坐在主席台上，两翼就是正式观礼的11国总理和43国外长。
“来宾们，女士们，先生们，朋友们——大家好”，对着话筒，刘前义努力使自己平静下来，“今天，我们在这里将见证一个历史性时刻的到来，这一道海峡——将不再是我们的不可逾越的鸿沟，我们终于完成了60年的企望，我们——将不再是离家的游子，我们回来了——”
为了宣泄自己的情感，刘前义的最后两句话几乎是喊出来的，但是后面的话语已经无法再继续下去，宋楚喻立即接过话头，“现在我宣布，中华人民共和国台湾特别行政区临时政府和临时立法会成立大典开幕——”
礼炮骤然响起，56门大炮6分钟内齐鸣60响。
“现在，请台湾特别行政区行政长官马英九宣誓。”
马英九大步走到主席台前，站在主席面前，左手持《基