获得此项消息的绿营立即组织起来，宣称国民党就是“新台湾~自由联合会”的幕后黑手，表示拒绝承认选举结果并以“当选无效”为由向台最高法院提出诉讼，要求判决“选举无效”并重新选举，同时以国民党舞弊为理由发起了“正名”行动。
1月9日，在绿营的唆使下，控制台北县政权的民进党执委苏贞昌发动了10万支持者汇集于台北市凯林格兰大道举行示威，要求最高法院判决选举无效。同日在台南、高雄、台中、花莲、屏东、台东等地均发生了绿营的大面积游行。
在绿营的大力鼓动下，传统绿色支持区内迅速掀起了一股拒绝承认选举结果的运动，在民进党的强势地区甚至发生了焚烧“国旗”、呼吁独立并攻击蓝营支持者和国民党党部的行为。
黑帮分子也顺便裹协其中，大肆进行抢劫。“新台湾~自由联合会”再次发表宣言，表示将为“台湾民众的自决和独立战斗到最后一口气”，同时对绿营对自己的误解进行表白说“吾等自民国60年开始就认可自己为台湾人，现在却不能获得主张自决的绿营认同，简直是亲者痛、仇者快”。
选后的混乱局面仍然在继续，1月15日，在绿营煽动下，岛内约100万人上街示威，要求重新进行选举。亲绿营的艺人纷纷上街鼓动，绿营媒体连篇累牍地对“新台湾~自由联合会”的情况进行介绍，引用美国的调查结论暗示原本支持国民党的苗若虎等人在国民党支持下搞的“苦肉计”。
外部媒体也纷纷乘机浑水摸鱼，日本多家电视的中文节目也横加猜测说台湾的选举前的混乱局面完全是大陆操纵的。美国之音、亚洲自由电台则煽动说“台湾人民现在到了决定自己命运的时候，应该勇敢地站出来和压迫者进行斗争”。
在多方面的挑唆下，1月19日，岛内又发生了约180万人上街的游行，南部地区也出现多起针对蓝营人士的围攻，数百人受伤。高雄市甚至发生了一起骇人听闻的恶性案件：支持蓝营的父母和支持绿营的女儿发生分歧，连续3天争论都没有说服对方，女儿竟然伙同男朋友将父母砍死并焚尸。
面对台湾出现的混乱，中国政府通过发言人表示：台湾民众有自己的判断，相信代表大多数选民的（国民党）可以处理好这件事。
1月24日，台“最高法院”初审判决下达驳回民进党“选举无效”的诉讼请求；2月9日，再次判决驳回民进党“当选无效”的诉讼请求。
针对判决结果，民进党表示要继续进行抗争号召绿营举行“全台总罢工、总罢市、总罢课”以进行“最后的抗争”。2月12日，全台约300万人参加了“为台湾正名，抗议选举舞弊，反卖台”的大示威，南部大多数地区的政府机构、商店、学校关闭停课。同时发起了“决定台湾前途的公投”，要求进行“统独议题的公民投票”以决定“台湾人民的前途”
持续的混乱局面导致台湾经济受到了严重影响，12月和1月进出口额仅245亿美元，比去年同期下降了32％，全台外汇储备跌至880亿美元，股市比11月30日下跌了24％，失业率已经攀升为11。25％。中南部山区的情况更糟，动荡的局势和绿营支持者的罢工导致经济基础本来就薄弱的地区是雪上加霜，为数不多的几家外资企业倍受困扰，被迫停产并撤离主要管理人员到台北，连累着本地的十多家大型工业企业也宣布暂停业务，大量资金开始逃至北方甚至流向欧美地区。
反过来，绿营又煽动说：看吧，外省人不仅*阴谋赢了总统和立法院选举加剧对本省人的压迫和剥削，现在已经不收购粮食和农产品了，要不了多久，外省人就要勾结大陆人来控制我们了。
当然，在中南部除了蓝营以外并不是所有的人都支持所谓的独立，工商业主和白领阶层已经在两岸的经济交流中获得了较大的好处，他们支持绿营的本来目的就是因为看不惯国民党的骄狂和北方人对南方的过度压榨，所以当真的让他们来决定是否独立或者是统一时，他们肯定是希望保持现状的。但是，由于在中南部他们的数量并不是很多，加上绿营同时发起的“决定台湾前途的公投”要求进行“统独议题的公民投票”以决定“台湾人民的前途”的运动让不少支持者已经是骑虎难下，被迫一步一步地跟随着绿营进行抗议和示威。
2月14日，台法务部召开记者招待会对中南部游行示威中出现的大量抢劫、纵火、攻击蓝营支持者和政府机构的行为进行了揭露，并针对美日记者的刁难出示了证据和大量的照片和视频。
最后，法务部长林正平对绿营作出了严厉警告“自由的政府从未限制公民表达自己意见的方式，也未限制表达意见的时间，但在表达这些意见的同时不能以破坏法律的基础也就是私人财产和公共利益为代价上述活动严重违反了大多数民主国家共同的规则，已经导致经济崩溃和民众财产的损失，政府必然将采取断然措施”，同时宣布台军已经做好了准备将采取戒严、军管等办法来彻底解决。
2月15日，各国媒体对台形势和政府的纷纷作出了报道，欧洲人在转载林正平讲话的同时也刊登了台独分子进行破坏活动的证据。美日媒体就异常卑劣完全不提正在蔓延的绿营破坏活动，反而宣称“现有的证据显示，国民党看来已经准备勾结中国放弃民主自由的理念，对民进党等反对派进行打击已经堕落成为了独裁政府”。
2月16日，中南海召开政治局紧急会议，总理向党内通报了出访欧洲的成果和协议情况，列席的外交部长、军事情报局长分别就各自领域的问题回答了政治局29名委员的质询。
最后，总参谋长以特有的山东口音对委员们发表了极其重要的说明：“1月4日去年租借的”北风之神“战略导弹核潜艇的训练和战斗演习已经顺利结束，2月4日正式开始战备值班。也就是说我国初步具备海基二次全球打击能力，12枚射程13000公里洲际弹道导弹上的144颗核弹头可以覆盖全球，而不再需要从我国沿海前出5000公里1月12日俄罗斯赠送的3架TU…210战略轰炸机飞行机组全部考核过关，1月24日组建的战略轰炸机大队正式开始战备值班，4000公里作战半径加上我国自主研制射程5000公里的”后翌之箭“巡航导弹让我们目前同样具备了空基远程核打击力量。”
“还是公布特别反应部队的情况吧，也该向大家正式通报了”，主席轻轻地对总参谋长示意。
“好的，总书记同志。各位委员，大家可能都知道去年在伊朗抗击美国侵略时，我们派了一个170人的特遣队，在战场上对美国采取了多方面的打击，网络战、航母袭击战等等都是他们的杰作，让我们对正在面对的美军有了很好的了解，也积累了十分重要的临战经验。
这支部队就是直属总参谋部的中国人民解放军特别反应支队，支队长是张羽大校，政委是原任总参谋部规划局副局长的熊浩欣少将。经过3年多的科技强军建设，目前编制2个防空营，2个装甲营，1个特反营，1个网战营，4000人。他们将是这次对台问题解决的关键，也是我党、我军和全国人民的“杀手翦”武器之一。
“4000人？他们能够在可能的对美战争中起多大的作用呢？”分管经济的国务院副总理王风华惊讶地问。
“是啊，4000人，是否太少了点呢？”分管政法工作的刘凤英也表示了怀疑。
“是这样的，以在伊方的战斗评估结果来看，目前一个满编的防空营36具激光器72人可以胜任阻击90到120架F…14战斗机的任务。1个装甲营24辆08式坦克完全可以对抗3个美国现役M1A2坦克团的攻击。”
看着委员们惊讶、怀疑的目光，主席挥动了下手打断了交头接耳：呵~，3年前，我们秘密组建了特别反应大队到现在已经初步成军，情况介绍已经只能到这里啦，还有什么问题可以问总长。
看着委员们惊讶和怀疑的目光，主席挥手打断了他们的交头接耳，总长继续解释：“3年前，我们秘密组建了特别反应大队到现在已经初步成军，情况介绍已经只能到这里啦，还有什么问题可以下来继续问。我们的新型驱逐舰和飞豹轰炸机已经改装了新式的革命性的武器装备，各型战斗机也装备了激光器。”
主席握紧拳头，站了起来，慷慨激昂地接过话：“台湾自古以来就是中国不可分割的一部分，台湾的事物不能允许外国来干涉，这就是我们的底线！美日两国正在试图以一场局部战争来破坏经济发展和我们正在进行的科技建设，但是在英勇的中国人民面前，他们必将碰得头破血流，我们也必定将以一份完美的答卷来交给党和全国人民！”
委员们充满了兴奋也被主席的讲话所感染，纷纷拍起手来，主席摆了下手：“还有一个重大事件要公布，经过中纪委、国安部、监察部连续11个月的艰苦奋战，已经追回了1800多名外逃人员和国内潜藏的贪污腐败分子290亿美元财产！大家算一下，一个贪官吞掉了老百姓多少血汗钱？1600万美元，好，我不说了，在座的各位请注意，如果——有什么需要告诉党组织的，请立即找总理讲清楚，别到纪委找上门来的时候再来求我！”
第二集 宝岛行 12、叛乱
“支队长，该通知他们回来吧”
“现在的形势还是不容乐观啊，虽然绿营已经被压下去了，但是直觉告诉我，美国人和倭猪肯定没有这么容易就认了理由，绿营至少在相当长的一段时间不能翻身，这样任由两岸发展经贸和体育往来的话，统一已经指日可待，美国人不会甘心的，我总觉得
而且，根据分析，美国人可能已经制订了一个计划准备和我们再较量一次，一是报复特遣队，二是破坏海峡两岸的正常交往，三嘛，倭猪已经坐不住了。“
“看见倭猪就有气”