名义上明朝对台湾琉球乃至日本都有宗主权，因此这个协议是合法的，尽管台湾土著并不知情。于是荷兰人进入台湾并开始开发征服活动。当时的台湾政治格局复杂，沿海有中国海盗以及西班牙的据点，内地则属于土著部落。荷兰人很快打败在台湾的中国海盗和西班牙人。对于台湾土著，荷兰人派出传教士，传教士在台湾取得了巨大的成就：土著人皈依了基督教，并且成为荷兰人忠实的臣民，荷兰人为台湾土著创建的用拉丁字母拼写地文字，甚至一直沿用到满清乾隆皇帝统治时期。
随着明朝最后一个皇帝永历皇帝在大陆的节节兵败，南明将领郑成功见中原大势已去，就开始打台湾的主意了。1661年，郑成功借口其父郑芝龙当海盗时曾在台湾屯田，因此声称台湾是郑家故土，于是战争爆发，郑成功的军队很快扫荡台湾全岛，包围赤嵌楼。荷兰人不得不向郑成功投降。郑成功占领台湾以后，在台湾设置府县，自此台湾成为中国的领土。荷兰人的军队虽然被打败，但台湾土著并没有向郑成功屈服，明郑军队遭到台湾土著的顽强抵抗，损失巨大，郑派往北方屯垦的三千军队被土著民全歼，派往二林村社的明军也被土著歼灭。当土著民的抵抗最终都失败了。大量的中国移民进入台湾，并从根本上改变了台湾的人口构成。
卢俊义拘于山东战事，无法抽身前去流求一趟，但他十分清楚，每个未开发的大陆都有极端野蛮的土著，像北美的印第安人和澳洲的毛利人，流求岛上的土著野蛮一点毫不例外。
不管他们再野蛮，也有让他们归于教化地办法，难道我卢俊义还赶不上那些荷兰人。卢俊义紧急调派公孙胜和他的几十个弟子前去流求给那些土著传教。
基督教的传教士的传教热情不亚于他们所抨击的魔鬼，他们妄图以一个宗教取代世界所有的宗教，卢俊义相信那些荷兰人向那些土著推广基督教时，也牺牲了不少传教士才获得那些土著的信赖。这一点上，其他宗教比不上，但是玄教完全不同。玄教有一个大神棍一清道长公孙胜，对于那些识字明事理的就给他们宣扬教义，玄教的教义融合了各大宗教所长，在吸引文人方面甚有办法，对于那些愚昧的百姓甚至这些土著，公孙胜就施展出道术。
公孙胜在流求岛传教地典型一幕：公孙胜如羽化仙人，仿佛从太阳上下来，从阳光处显露，头上一圈光环，缓缓地在空中踱步，然后慢慢地降落下来，落在土著中间。然后蜗居的竹楼群里最大的一栋轰然爆炸，火光冲天。继而公孙胜地道袍轻轻一挥，又起了一阵大风，将土著部落的竹楼全都付之一炬。然后公孙胜从背后抽出一副画卷，摊开扔给那土著部落地酋长，指着港口外停靠的义军海船，说出一句土话：“投靠那伙人，奉他们为主人，他们会帮你们建造出画里面地房子，皈依玄教，神会保佑你们！”如果那些部落冥顽不灵，还试图袭击公孙胜，公孙胜就从身上取出几个黑黝黝的东西，扔了出去，将来犯地土著当场炸死，并呵斥道：“神会惩罚你们这些坏人！”或者公孙胜袍袖一挥，一股大风将来犯的土著吹起来挂在树枝上。如果有些部落有疫病，公孙胜就拿出药物治好了土著的病，如此恩威并施后，公孙胜又缓步升上天空，然后慢慢地消失不见。
如果那土人还犹豫着不去投奔义军，公孙胜会再度像天神一般在天上出现，手中拿出奇怪的物事将那些土人都照在那里面，那些土人看到自己的样子清晰可见，都吓了一跳，公孙胜便又用土话威胁道：“我已经摄了你们的灵魂，再不降顺与他们，违背天意，必遭天谴。”那些土人惶恐不安地伏地求饶，公孙胜用手指着义军的船只：“跪伏过去求降，就饶过你们，否则就再用这镜子照你们！”那些土人无好跪伏着向义军求饶，随后义军就派出通译跟他们做贸易，用陶瓷、丝绸等精美制品来换取他们的土地。由于大部分的部落都是渔猎为生，不懂耕种，那些河流附近的冲积平原对他们没用，就欣然接受了交换。
公孙胜的道术并不支持飞翔，他是被一个大风筝带上了天空，风筝的骨架被他大大的道袍挡着，风筝的线是结实透明的天蚕丝；他的道冠上缠着一个透明玻璃环，被太阳一照就会发出一圈耀眼的光环；双手一挥扔出去的是手榴弹（这时已经是公元一一一六年了，这种土制炸弹也就发明出来了）；黑黝黝的东西自然也是手榴弹，那个奇怪的物事是水银镜子，至于突然刮起大风，确实是公孙胜的道术所致。
公孙胜只负责大部落，大部分的小部落就交给公孙胜的弟子出马，如果他们弟子摆不平了，公孙胜再出马。李俊分兵五路，按照主公卢俊义绘制的地图，配合玄教的传教士，四处攻略。首先将北起彰化南至高雄的台南平原拿下，台南平原面积四千五百平方公里，为海岸平原，是台湾最大的平原。又拿下屏示平原，它面积为一千多平方公里，为冲积平原，是台湾第二大平原。陆续又拿下宜兰三角洲平原、台东纵谷平原、新竹平原和恒春平原，当然台北续被拿下。
第三章 经营流求
公孙胜带着他的弟子们将那些土着们忽悠住了，将那些土着们本身就弃之如敝屣的平原和盆地给占了，还给了这些土着部落的酋长们一些精美的丝绸、陶瓷等制品。那些土着还以为神要他们投靠的人很傻呢，所以对李俊的海军也生不起什么敌意。
有些生番土着尚处于食人部落阶段，桀骜不驯，劫杀落单的义军士兵，李俊知道这个情况后，抑制不住满腹的忿恨，发动一个师的兵力，动用弩炮、神臂弓，将这个五千人的部落，流求岛上最大的生番部落全数剿灭，不管男女老幼尽数坑杀。在用弩炮抛出炸药包炸毁那生番部落聚居地和坑杀那些食人部落部众时，李俊特意邀请其他土着部落的人前来参观，通过澎湖人通译转告那些土着：“顺我者昌逆我者亡！”
从澎湖移居到嘉义的四五百汉人中，有一百多人都学会了土话，甚至有些人跟土人通婚，去了土着的女子。李俊便任命这一百多汉族男子做通译，做为义军和土着的沟通桥梁。
土着们打猎或者捕鱼得来的猎物就可以通过那些澎湖通译做中间人和义军做生意，从义军手中得到那些精美的制品，当然还有一些茶叶和白酒，这些部落的酋长们都喜欢上了汉人的这些东西，他们本来想抢了汉人的东西。但经过李俊剿灭那食人部落后，他们知道自己怎么也打不过汉人。汉人地弩炮能一下子就将他们好不容易建立起来的房子给炸毁。而且汉人不仅跟他们做生意，还给他们盖房子，还教会他们怎么耕田，还教他们的孩子认字，比起那些整日跟自己部落争斗的其他土着部落，汉人好太多了。公孙胜见流求的局势慢慢稳定下来。就留下他的弟子们继续传教，他自己返回山东。展现神迹和恫吓后，再行传教时，没有那个部落不愿跟从地，很顺利地，玄教将土着部落征服了。当然流求这里的玄教不同于中土的玄教，教义很简单，拜盘古、伏羲、女娲三神，效忠汉人，即可上天堂。否则下地狱。
流求岛上大大小小的土着部落有二百多个，大的部落有数千人，小的部落几百人，合起来有近十万人。这十万人都归顺义军后，便成了义军建设流求的主力之一而不再是阻力。
卢俊义很不想在汉人攻取流求的时候发生西班牙人攻取美洲大陆时的悲剧，到如今较为和平地接受流求，他很欣慰。他想起一件事情，不禁哑然失笑，要知道。这些土着，这就是后世台湾原住民的祖先，张惠妹也是原住民，把这些土着看成是卢俊义很喜欢地一个歌手张惠妹的祖先，想象着这些土着们正在唱着“连绵的青山百里长呀，巍巍耸起像屏障呀喂，青青的山岭穿云霄呀，白云片片天苍苍呀喂”，卢俊义不禁哈哈大笑起来，心情轻松了许多。
流求。讲起这个名字，卢俊义就生气，也不知道谁起的鬼名字。真绕口，又容易误认为是琉球。卢俊义下令给李俊和协助李俊经营流求的卢俊信，诏谕流求岛和澎湖周边的所有人。流求在李俊海军到达嘉义时的那一天，正式更名为“台湾”。
李俊海军在北宋政和六年。即公元一一一六年，这一年的七月初八到达嘉义。七月初八这一天，也定为台湾岛地自由日，日后每一年的这一天台湾岛上的所有居民全部放假，可以尽情狂欢。而且，至此开始，台湾岛上所有的地名，都依照主公卢俊义绘制的台湾地图。
台湾太大了，义军的人力严重不够，就是再加上那些自愿依附帮忙的土着人，也不能一下子将台湾全面开发，只能一点点地开始建设。先开发的是淡水平原和台北盆地，这里距离山东半岛最近。卢俊义派卢俊信带着卢家家人、伙计，领着一万愿意出海发展谋求更多田地和财产的山东、河北的流民，坐上密州船舶司地大船，从山东日照出海，经郁州、舟山、洞头，几度补给，前往业已被李俊海军占领的淡水。
卢俊义暂设台湾为一个府，任命卢俊信为知府，李俊兼任台湾府的兵马总管。卢俊信全面负责台湾府尤其是台北县地屯田工作。
卢俊信在治台之初，便清楚地意识到卢俊义交给他的任务已经不同于以往，他回信给卢俊义称“为治之道，在于足食，台湾土厚泉甘，膏壤未辟，当用寓兵于农之法，庶可以足食。”
当时地台湾。平原盆地上一片片荒草。渺无人烟。只有山上有一些土着部落。这些土着平素以渔猎为生。不习耕种。将台南平原为主地大片沃野尽数荒废。却正便宜了对这些沃土垂涎三尺地梁山义军。当卢俊信开始垦荒时。发现一个非常严重地问题。他带来地都是黄河流域山东、河北等地地农民。这些地方种植地多是小麦。几乎从未种植过水稻。而台湾湿热多雨。不适合种植小麦。幸得那群澎湖人说他们�