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波塔在报告中提出的另一主张就是，为了拯救美军士兵的性命。他指出，1943年11月在基里巴斯达莱岛的佩迪奥登陆战中，美军虽然投下了3000吨高性能炸弹，但登陆战仍不能轻易取得成功，战斗只进行了4天，美军就伤亡近4000人。波塔称，假如在同一个遭到日军顽强抵抗的地方，只要投下900吨芥子气炸弹，美军就能毫发无损地占领该岛。
当时，波塔在报告中就得出这样的结论：“如果使用得当，毒气可以尽早结束在太平洋上进行着的战争，避免使更多的美国士兵在战争中丧身。”
他指出，出自日军在中国及亚洲地区使用毒气和美军伤亡增大的原因，美国的社会舆论要求美军对日军使用毒气。他主张：“因为日军在继续使用毒气，因为美军出现的巨大牺牲和对日军的残暴所受到的刺激，因为社会舆论的压力，在太平洋上进行毒气战，也许是迟早的事。”
因此，波塔的意见书明确表态，进行毒气战，是为了对日本在中国和亚洲地区使用毒气而进行的制裁，同时也为了减少美军的伤亡人数。而且，意见书中提出，为了减少美军的伤亡人数，美国必须先发制人，抢先使用毒气。
没有道义上的反对意见
这份意见书，经陆军总部作战部的幕僚们讨论后认为，使用毒气，时间尚早。主任幕僚T·汉迪少将于1943年12月27日如此概括作战部的意见：毒气战一旦开始就无法控制。对日本使用毒气，恐怕会诱发德国大规模地使用毒气，给同盟国进行的欧洲大陆登陆战役造成威胁，因为防御方如果使用毒气，将会成为非常有效的防御手段。因此，不能给德国以使用毒气的口实。
美国可以使用毒气，因为美国市民几乎不会遭到报复的危险，但是在同盟国即英国、澳大利亚、前苏联、中国，就并非如此。同时，在太平洋上进行大规模毒气战的筹备工作，会产生数量庞大的部队和大量运输船以及化学战弹药的保养等兵站上的问题。
于是，“使用毒气时间尚早”的理由，就只是战略上的原因。令人注目的是，由于侵华日军在中国施放毒气和细菌，德军使用毒气大规模屠杀犹太人，美军在提出这份实行毒气战的报告时，没有一个人对“打毒气战在道义上不人道”持反对意见。
不久，在战略上暂时不宜使用毒气的论据，随着德国的即将投降，眼看就要消失了。
然而，就在这时，日本政府于1944年初采取的两个行动，意想不到地促使美军决定对日本实行毁灭性的打击，正式进行奥林匹克作战计划的制定和对日本进行毒气战的筹备工作，并将对日毒气战即奥林匹克战役计划的编号定为“JCS825”。
日本政府通过国际红十字会向美国传达了对美国准备向日本使用毒气的舆论引起的忧虑，同时日本特使还会见罗马法王，委托他向美国传达日本决不使用毒气的承诺，要求得到来自美国的明确答复。
日本特使的承诺还包括“日本军队在中国绝没有使用过毒气”的内容，美军参谋总部已经通过情报证实这一承诺极不诚实，于是再次发表美国总统罗福斯的声明，并于4月得出没有必要再发表过多声明的结论。
事后，美国军方马上就发现，在美国总统的声明里具有的那种对日本实行沉重打击的准备工作做得还不充分，因此陆军航空部队司令官阿诺德于6月将此作为备忘录向美军参谋总部提出，于是对日毒气战的准备就加快了步伐。
配备11万吨毒气弹
1944年8月，美国决定对日实施报复性毒气战的筹备工作结束日，定为1945年1月1日。
可是，到1945年之前，如果美军不能到达能对日本本土发起战略性毒气攻击的位置上，即在中国、菲律宾等战略性使用毒气，那么同盟国的国民也将受到更加深重的灾难。因此，美国军方决定重新讨论毒气战的作战方案。
1944年10月，美军参谋总部经过再次讨论，最后决定，将对包括冲绳诸岛、小笠原诸岛在内的日本本土进行战略性毒气战的筹备工作结束日，定在1945年4月1日，将对在亚洲、太平洋地区的日军进行战略性毒气战的筹备工作结束日，定在1945年1月1日。
同时，美军参谋总部还制定了作战方案的大纲，战略轰炸以B—29和B—25飞机投掷毒气弹为主，在开始的15天内进行最为集中的轰炸，在最初的1个月内投掷1000磅重的非持久性毒气弹（窒息性光气等）23340吨，500磅重的非持久性毒气弹6280吨，100磅重的持久性毒气弹（芥子气等）23280吨。
为了能使各项命令通达太平洋战区的美国陆军各司令官，为了能使美军在毒气战筹备工作结束日马上实施毒气战，在这一作战方案的12月14日的附件内，还制定了将毒气弹配置前线司令官的决定。可是，因为各种筹备工作的延迟，尤其是全力以赴致力于德国的投降以及军队的紧急输送，1945年3月5日，美国军方参谋总部指示，重新讨论毒气战筹备工作结束日。
到1945年4月，奥林匹克作战计划已经基本制定。德国法西斯于1945年5月7日投降。因此，最后美军参谋总部经过确认，再次确定“将筹备工作结束日定为1945年11月1日，生产足够的毒气弹，用以从这天起就能随时实施报复性毒气战”的方针。
根据这一方针，规定在毒气战筹备工作结束日之前，113500吨毒气弹能够配置在太平洋——中国战区，用于1945年11月1日开始的、被称之为“奥林匹克战役”的日本九州登陆战。
九州登陆前施行毒气攻击
美军参谋总部在制定这一方针之际，就按美国总统罗斯福的声明精神采取了制裁的方式，即：在这一期间，如果日本仍执迷不悟，继续使用毒气，就对日本实行毒气制裁。美国的毒气战筹备工作就此正式拉开了帷幕。
可是，正如前述，日本已经间接地向美国表明不首先使用毒气弹。据“奥林匹克战役计划”第六部分分析，日本除了最后的孤注一掷之外，不敢贸然使用毒气弹，而且即使到了战争的最后关头，日本尽管已困兽扰斗，估计他们也不敢向美国使用毒气弹。
尽管如此，美军截获的情报证明，由于德国法西斯的灭亡，日本在中国和东南亚的军队已经进入疯狂的状态，开始销毁建立在那里的毒气与细菌设备，屠杀在那里的俘虏，并根据种种迹象表明，日军仍在那些地区施放毒气与细菌。因此，美军的毒气战筹备工作仍在紧锣密鼓地进行着。
这时，因奥林匹克战役的筹备工作，兵站的能力达到极限，美军参谋总部策划部根据上述“奥林匹克战役计划”第六部分的分析，理所当然地提出质疑，怀疑这么做是否值得。
然而，此时参谋总部策划部的质疑已显得微不足道，陆军总部对奥林匹克战役攻击目标的研究工作加紧进行着。
首先，据陆军总部作战部计划，在奥林匹克战役计划第六部分的基础上，在1945年6月1了日制定的目标研究“第二草案”中列举出地图上的那33个目标，指出日本防毒设施的弱点，得出这样的结论：在奥林匹克战役中，战略性和战术性地实行毒气战是“有实效的”，而且是“有利的”。
毒气战开始日从登陆作战的3天前起，对日本的港口、海军基地、交通要道（停车场、铁道修理工厂、铁道换车站）、准备登陆的海岸、航空基地、地方军司令部、给养厂和兵器厂等进行芥子气和光气攻击之外，计划对佐贺、福冈、大分、熊本、门司、松山、广岛、吴等城市的中心地区进行以芥子气弹为主的攻击，福冈、八幡等的供水设备，用芥子气进行污染。
接到这一方案后，作战部的M·J·约翰逊大校向林肯将军推荐，除九州南部和坨岐、对马、松山以外，对其他城市进行的毒气攻击，应包括东京等六大城市在内，并建议“实施奥林匹克战役，为了达到战略性突破的目的，应尽可能地使用毒气支援作战”。
他主张，如果采用全封闭歼灭战的打法，即使用不着让日本崩溃，也能诱使日本投降，但在这时，美军必须抢先使用毒气。
其次，上述介绍的CWS（化学战后勤部）的目标研究，是以奥林匹克战役计划第四部分为基础而制定的，从1943年到1945年在美国犹他州道格霍伊实验场和巴拿马附近的圣何塞进行的各种毒气使用实验等为基础的、真正的报告。
10月中旬轰炸东京
配置用于毒气攻击的航空机，从马里亚纳起飞的B…29飞机616架（1个月内毒气弹投下量61600吨），从冲绳起飞的B…29飞机232架（毒气弹投下量37120吨）、B…24飞机216架（毒气弹投下量7020吨），光这些战略轰炸机，1个月内就能投下105740吨的毒气弹。
而且，在将会受到攻击的日本城市有3座，报告中还指出了具体的攻击区域。
首先是人口密集的东京，美军将攻击开始日定为奥林匹克战役开始的15天前的上午6点，是以“用光气弹战略轰炸市区，进行大批杀伤”为目的。选择光气，是因为在10月中旬的早晨，在东京的低气温下，芥子气的效果会减弱。
目标从皇居北起，正北到后乐园、六义园、王子车站一带，正东到两国桥一带，以及被围在隅田川西岸的17．5平方英里（44．8平方公里）内，以因空袭而成废墟的文京区为中心，包括神田、上野、浅草、干住、日暮里、田端等。
投下的弹药量，由B…29投掷t000磅炸弹5420颗或500磅炸弹21680颗，这一地区的人口94万8千人，估计目标地区风下2英里处的人口是77万6千人。
第二是对八幡（户田）战略性使用芥子气弹。目标是八幡2．8平方英里、户田2．25平方英里的工业区域和人口密集地区，预定在奥林匹克战役开始的3天前下午6时起，投下100磅炸弹18764颗。这一区域内的人口，八幡是15．58万人，户田是12．34万人。
除东京、八幡以外的23个城市，因为受到东京型的光气攻击或八幡