二天以后，尚可喜、耿仲明也都陆续来到了南京，洪承畴也分别找他们谈话，并且也都要他们各自交出一部分人马来，然后分別让两人去攻取湖南和广东。这两人也知道吴三桂己经答应了清廷的条件，以放弃一部人马的代价换取一个进取其他地方的权力，那里还敢说一个“不”字呢，也只能都答应了下来。
结果这一下洪承畴大约截留了近八万多人马，不仅加强了清军在江南江北的实际兵力，也使吴、尚、耿三人的实力大大削弱，同时还成功的敲打了三人一下，让他们不敢再轻易不尊湥⒌拿睢�
随后洪承畴又下令，命正红旗固山额真韩岱和耿仲明一起出兵，去进攻长沙的何滕蛟，收取湖南之地，又命正蓝旗固山额真觉罗巴哈纳，和尚可喜一起出兵，收敢江西、南直隶的其他地方，为下一步进攻福建、广东做准备。
不过在吴三桂、尚可喜、耿仲明三人出兵之前，又聚在一起密谋了一夜，虽然这一次清廷的分派是三人分取三个不同的地方，但在在三人都是栓在一条绳；谁也离不开谁。因此也必须加强互相的合作。最后三人决定，先按湥⒌囊螅髯猿霰×┐笞约旱氖盗Γ罢衣渥愕恪２⑶一ハ嘀涠家忧苛倒低ǎハ嘀С职镏Ｗ詈笕嘶轨ρ耍浇⒘私崦斯佤椤�
第五十章 清军整顿（三）
等吴三桂、尚可喜、耿仲明三人带军出发以后，洪承畴也开始着手整顿南京和江淮地区的军务。
虽然多尔衮承诺再拔给洪承畴十万人马，但这十万人马不可能一下子凑齐，因此先期洪承畴只带来了五万人马，同时也带来了一批火器物员，这时也都陆续到达了江北、江南地区。
现在清军集中在江淮和南京地区的兵力约为二十五六万，并且拥有大量火器，计有各种火炮四百五十余门，其中红衣大炮有近百门，霹雳火炮一百二十余门，火铳二万二千余杆，煫发火铳有一千五百余支。霹雳火箭有二千余筒，震天雷有五千余个。虽然湥Ь幕鹌魇恐幌嗟庇谏碳揖牧礁鍪τ涤械幕鹌鳎跍＇廷来说，这己经是把所有的库存火器全部都拿出来了。
俱体的兵力比例为：满旗及三大营的军队，约为四万五千余人，另有跟役包衣约有一万五千人。因为在多尔衮改制以后，一般的满旗兵出战，是不允许再带跟役包衣，只有白甲兵、牛录、甲喇等少数精锐，或将领级的人物才能带一定的跟役包衣出战。主要的将领有固山额真四人：正白旗阿山、镶蓝旗屯齐、正黄旗谭泰、镶黄旗尹拜图，宗室有多罗贝勒勒克德浑、贝子尚善、满达海。而梅勒额真有：珠玛喇、瓦尔喀珠玛喇、卓罗、泰什哈、蓝拜、硕詹、阿哈尼堪、阿济格尼堪等人。
汉旗及绿营军队约有八万余人，主要的将领有固山额真有：镶白旗佟图赖、镶红旗石廷柱、镶黄旗刘之源、正红旗金砺。梅勒额真有：马光辉、海尔图、李思忠、士彦等，其他汉军将领有沈志祥、吴朝佐、金光裕、夏成德、刘武元、佟岱等人。
蒙古旗的军队有两万五千余人，主要的将领有：固山额真马喇希、吴喇禅、革霸库、富喇克塔等人。
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而洪承畴整军的重点当然是南征之后收降的明军。因为满汉旗军、绿营的编制己经比较完善了，用不着洪承畴来重新编整，而且这里的关糸也错综复杂，洪承畴也不愿意去趟这滩混水。收降的明军不仅人数众多，而且来源也十分复杂，而且各将手下的兵力也不相等，有多有少，不过洪承畴下令将其全部打乱，然后重新分组整编。
洪承畴将降军一共为八镇，四大四小，以刘良佐、刘泽清、左梦庚、金声桓四人为大镇，每镇拥兵一万五千人，土国宝、刘进忠、王得仁、郝效忠四人为小镇、每镇一万人。这样一样各将的兵力都拉平了，不会有特别突出的。
在兵力的分布安排，洪承畴在江北布置了十万人马，甴贝子满达海坐镇归德府，全面指挥江北的军务，另外还有阿山、谭泰、佟图赖、石廷柱满汉各两名固山；而在南京一带布置十二万左右的兵力，由多铎在南京坐镇，手下有屯齐、尹拜图、刘之源、金砺。以及蒙古各旗等人。其余的人马都作为机动兵力。
同时又命山东的阿巴泰，派遣一部份人马驻守兖州，牵制商家军在鲁南的兵力，减轻自己在江淮一线的压力。
而在文治方面，洪承畴委任申朝纪出任河南巡抚，吴景道任河南布政使；张文衡为淮安府知府，兼授淮安道；金之俊为凤阳府知府，兼任淮安巡抚；马之先为武嫒魏阊哺В跚逄┤魏辈颊梗磺厥漓跷涎舶矗♂肺喜颊梗对鸸芾砀鞯氐拿裾挛瘢哺裰冢妹馇浮⒒指瓷２⑶蚁铝罡鞯刈ぞ坏萌琶瘛�
同时洪承畴又向湖南、江西、安徽各省发檄进行招抚，只要是向清军投降，原官、司均可留任，并不念旧故。并且又严令耿仲明、尚可喜等人，凡事主动向清军归降的各州府县，均不得侵挠劫掠，当以安抚为主。
不过对商家军的措秩则是实行全面封锁，洪承畴要求，在浙江、江北、山东地区，完全封锁住双方的边境线，绝对禁止有人通过边境，和商家军联糸，也严禁商贩前往商家军的地区经商。一经发现，必然严惩。
因为洪承畴了解到，现在商毅的主要财政来源是依靠海外的贸易收入，仅靠浙江一省的生产，根本就支持不了商家军的战事开支。但进行海外贸易，需要靠內陆提供大量的商品，才能为海外贸易保障充足的货源。尽管现在浙江可以自行生产大量的生丝和丝绸，但其他商品也都需要从内陆购进，为了吸引商人，浙江地区己经将商品的收购价格提高了三倍。
为了追求大的利润，在商家军和清军对持的时候，乃然有许多商人冒险将各种商品，穿过清军占领地区，运到浙江来贩买。当然在通过清军防区的时後，商人都会向他们进奉大量的钱财进行贿赂。而这一笔钱自然也都落入了私人的腰包中，因此各地驻守的清军对此也是睁一眼闭一眼，毕竟和钱过不去的人还是少数。而且商家军安插在南京、江淮的情报人员，也主要是通过这些途径，把情报消息传入到浙江。
洪承畴对这种现像当然十分清楚，因此才下令必须全面断绝，彻底浙江的商品供应，虽然在短期內效果不会太显著，但时间长了，虽然不能从经济完全拖跨商毅，但也可以使浙江的收入大减，从而大大削弱商毅的力量。同时也可以加大商家军的情报传递的困难。
对洪承畴这样的安排布置，多铎也全力的支持，并且派自己的亲卫队组成监查队，在各条防线进行巡查。
而在湖北地区，不过洪承畴到并没有急于向商家军的湖北根据地发动进攻，因为军队重新编组，调整都需时间。只是首先命令贝子尚善领军驻守黄州，为下一步征剿湖北的商家军做准备。而且封锁得也更为严密，在双方的边境线附近，一屡不许驻留人口，房屋建筑田园一屡拆毁。凡是敢和商家军有来住的人员，一屡格杀无。要将商家军在湖北的根据地彻底孤立起来。
因为洪承畴知道，商家军在湖北的根据地还不能达到自给自足，需要浙江的支援，而浙江对湖北根据地的支援，主要是依靠长江水道，因此想要进攻湖北的商家军，首先就要阻止商家军从长江的援助。因此洪承畴也开始着手整顿湥Ь乃�
自从清军在龙山水战失利之后，湥Ь仓亟俗砸训乃扒昂蠛笥终骷剿奈灏偎掖笮〈唬还寰乃饕故歉涸鹪耸浯蠖尤寺恚约拔镒识山皇呛蜕碳揖岢そ目刂迫ā６仪寰衷谝仓郎碳揖睦骱Γ艘淮挝馊鹈跋沾右钦娑山猓寰揪筒桓以谀暇┚衬谝韵碌慕位疃善涫钦馐鄙碳揖剂炝私钡某荨⒑椭菀幌撸虼饲寰山牡氐愣忌柙诔刂莞耐暌淮Ｒ员芸碳揖乃ァ�
这样一来，从江淮传递到南京，都必须绕一个弯路。好在是目前江南的军需主要都是由湖广和本地供应，因此对清军的后勤供应影响不大。
洪承畴是福建泉州人，虽然在明朝的大部时间都是在西北、西南剿匪，但对航海、舰船也并不算陌生。而且现在洪承畴也知道，商家军在海取得的战绩，可以说商家军的海军实力，足以和郑芝龙一较下了。而现在商家军在长江占有绝对的优势，在短期内，清军是无法建立出一支能够和商家军相抗衡的水军来。好在是清军的目地并不是要击败商家军的水军，只是阻止搔扰商家军从长江支援湖北战区就行了。
这一点在目前来说，洪承畴相信湥Ь故亲龅玫降摹６疑碳揖拇铀淙磺看螅饕呛４芄辉诔そ泻叫械恼酱⒉欢啵４徒那穑槌谐氲比皇乔宄摹Ｒ虼嗽诔そ铮寰拇痪允恳錾碳揖啵被拐加杏沃庖坏阌谐そ兴剑鞘钟欣摹Ａ剿街埽蟛吭蚴乔寰皇煜に剑艺绞醪欢缘脑倒省�
于是洪承畴也下令，将清军所有的船只按大小进行重新编组，并且仍然将龙山船厂做为水军的前线基地。不过洪承畴也不敢大意，只是在龙山船厂里驻守三百多艘船只，其余的船只仍然停泊在池州一带。同时达继续在长江沿岸征集各种船只，并且命令各造船厂也都继续为清军生产新船。
然后洪承畴又在湖广、江淮等地招筹渔民充任水手，并从汉军中选拔精通水性，并且会操舟的士兵编成水军进行训练，制造水战的武器，积极的备战。