龚继昌和苏元春所部已经攻破张秀眉的村寨，戈鉴所部已经攻破杨大六的村寨。苗军残部集结起来，保卫乌堡和冷水沟，打算北进，但因春水盛涨，无法渡江。黔军又在河干拦截，龚继昌和苏元春所部挥军追赶，将苗军截为两段，斩杀几千人，迫使一万人投降。
这时天下大雨，张秀眉和九大白趁雨出走。龚继昌和戈鉴追到挂灯，斩杀九大白，将他的首级挂在竿子上。苗军见了，两万多人盘跪求降。
这一仗从4月19日打到5月5日，湘军与苗军鏖战十七天，将乌鸦坡二十里苗寨全部平定，留下苏元春所部驻扎当地，安抚投降的苗民。
5月7日，龚继昌部从台江排羊的南刀进占雷公坪，搜捕苗军余部，在战斗中斩杀岩大五。又于5月12日俘虏姜老拉。
龚继昌侦察到张秀眉和杨大六仍然躲藏在乌东山，便亲自带兵搜捕。四五百名苗军持短刀殊死抵抗。交战良久，张秀眉和杨大六仆倒在地，被湘军捕获。湘军又在白水洞抓到金大五。
湘军将俘虏的苗军首领全部用囚车押送长沙处死。其他苗军和教军首领，或者被俘或者被杀，没有人幸免于难。
当月，刘岳昭从云南派出吴忠奇部，会同黔军，于5月31日在贵州西南角上的兴义击败回民军，贵州的战事就此平息。
6月28日，王文韶实授湖南巡抚，吴文炳实授湖南布政使。
凯里战役结束后，四十三岁的东安人席宝田急流勇退，告病还乡。他在十几年的作战中积累了家财，骤然富甲一方，开始经营商业，不再回归仕途。
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贵州的局势平定下来以后，王文韶将贵州的苗疆绘图呈献给清廷。
他上奏说，苗疆山川险阻深幽，其中的地形和道路里程，就连当地土人也难以全部掌握。苗民身手矫捷，剽悍勇猛，凭恃险阻，很难寻觅他们的行踪。 txt小说上传分享
1872年，同治十一年（5）
清朝雍正年间才开辟苗疆，创建古州、台拱、清江、都江、丹江和八寨六座城市，称之为“新疆”，分设镇、协、营、汛及同知、通判等官员，由他们控制。乾隆二年增建凯里、鸡讲、朗洞、柳罗各城，布置更加缜密。
新疆的地界，跨越镇远、黎平和都匀三府之间，幽深盘曲。苗民在其中生息，人口约有五六十万，屯（屯下一个土字）寨星罗棋布，几乎没有空隙。
自从咸丰五年张秀眉领头造反，六城所属的苗民先后响应，占据了新疆全境，长年延续。黎平、镇远和都匀及所属各个城汛，全部受到影响。而湖南西部边界所受影响更大。
同治五六年，湖南的前任各位巡抚奏调席宝田统领湘军，大举增援贵州。首先击败荆竹园和轿顶山的教民，断绝了他们的增援。然后攻克江口屯（屯下一个土字）和寨头，在苗民根据地驻军，像雕一般四出攻击，开凿险道，攀缘幽谷，攻城克寨。通过七年的不懈努力，才有幸获得成功。
现在，湘军已经攻克新疆的所有六城，一千多里的苗疆，及其延伸的处所，全部安定下来。现在所有接受安抚的苗民，人口不过几万。从古至今，苗疆的战事，这次可谓登峰造极了。
历年来，湘军所到之处，深入穷搜，有很多是汉人未曾涉足的地方。前曾饬令统军的各位将领，将多年来攻占扼守阻击的要害之处，绘图呈进朝廷审核，以便随时调度。此事规划已久，苗疆的地形已经明了。现根据各军所呈的地图，以鄂尔泰新辟的苗疆为界线，综合出一份总图。凡是湘军攻克的地方，都粘贴标签注明。其中都匀、马哈、清平和黄平各边境，都是川军和黔军攻克的处所，无法全部了解用兵的日期，一概没有加贴标签。
王文韶说，他知道经理一个地区，图籍是很重要的依据，形势是险是平，必须考察前辙。谨绘图咨呈军机处，以备考核。
战火改变了苗疆的生活，苗寨只剩下了五分之一，居住其中的苗族百姓，都是清廷的顺民。这些居民中缺少能征善战的精壮男子，贵州东部无奈地平静下来。
王韶文向清廷献图之后，随即下令收兵。他采用陈宝箴的计谋，唆使各位营官主动提出只要一半军饷，这样需要领取的银子是三十六万两，全部由清廷供给。
湘军在贵州的军事行动宣告结束，仍然留下戍防军驻扎在沅州以西，由四名将领统领五千名军士。不甘屈服的苗民不时闹些小的动静，但不再能够造成大的影响了。
贵州的苗民起义在湘军打击下失败以后不久，湘军将领戈鉴在军营中病逝，享年四十岁。他在老师储玟躬死后，又度过了十八年的军旅生涯，却没能活到卸甲归田的那一天。
戈鉴是诸生出身，但他从小不屑于研读词章，却潜心于孙子兵法。作为一名带兵打仗的书生，他算是实现了自己的心愿，也可以说是死得其所了。
邵阳人曾纪凤受命办理战争的善后事宜。他在从黄平往西南延伸到贵定的二百多里地面上，修建了七十座碉堡，分设四屯，每屯都设屯官，派六百名军士分守，一面垦荒供饷，一面巡逻。
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岑毓英的部队在上年底攻克了馆驿城外围的白旗军碉垒，于1月25日攻破馆驿西门，进入馆驿，与白旗军同城对垒。
张保和的部队在馆驿以南作战，于2月21日攻克开远的田心，白旗军首领马世德不愿做俘虏，自焚而死。
杨玉科部则在云南西部杜文秀的根据地周边作战，于3月4日攻克大理以西一百里外的永平，接着攻克曲洞和漾濞。
李维述部也逼近了大理，于5月22日攻克大理东南方的云南县。
杨玉科、李维述和杨国发等部联合作战，于6月8日攻克毗邻大理的赵州，即今天所说的凤仪镇；又于6月20日攻克大理以南的茶马古道重镇蒙化，即现在所说的巍山。
赵州一仗，杜文秀亲自率领一万兵力出援，却无力回天，大败而返。到此为止，清军拆除了大理的所有藩篱，杜文秀白旗军的声势更加无望振作。
张保和所部于10月17日攻克抚仙湖以东的婆兮，即现在所说的盘溪。马忠所部于10月24日捕获馆驿白旗军首领马敏忠与马国政，将他们处死。清军将回民迁移到村寨居住，馆驿平定。
贵州提督周达武率部会同云南清军作战，于11月份攻克新城。
1872年，同治十一年（6）
杨玉科部于年底开始对白旗军的根据地大理发起攻击。
大理北临洱海，西靠苍山。杜文秀占据大理之后，在城内修筑了土墙，把他的大元帅禁城团团包围。
杨玉科令部队挖掘地道，炸塌东南城墙，部队从缺口冲入城内。白旗军凭靠土城奋力抵抗，杨玉科又下令埋地雷炸墙。从12月10日战到12月17日，杨玉科所部在作战中斩杀白旗军两千多人。
杨玉科把部队驻扎在内校场的莲花池，增调五六千兵力，围攻禁城。
12月25日，杜文秀率领最忠实的部队杀出禁城，杨玉科亲自率部迎击，斩杀白旗军五六千人。杜文秀率败军退入禁城。
12月26日黎明，杜文秀率全家沐浴完毕，服毒自尽，终年四十五岁。蔡廷栋等人抬着杜文秀出城，献给杨玉科。这时杜文秀气息犹存，杨玉科下令割下他的首级，送往昆明。交献杜文秀的蔡廷栋，曾在以前被围时投降清军，后来又逃往大理。
岑毓英已率部抵达红崖，距大理一百二十里。清军进占大理，将要等到下一年。
由于云南的清军已基本上消灭了杜文秀的白旗军，刘岳昭官复原职。
满洲正黄旗人景廉是清末有名的廉官，在这年春天率部抵达新疆古城，派使者把徐学功召到绥来的沙山。这里的绥来，就是现在所说的玛纳斯。
景廉让徐学功召集旧部三千多人，开设屯田，一边作战，一边耕种。这时文麟也将团练首领孔才从哈密召到古城，修堡建屯，孔才又收容徐学功的散勇二千多人，亦耕亦战。于是，吉田和吉木萨尔两地大兴屯田，军粮稍微充裕。后来徐学功与孔才都升任提镇，但事事都秉承将帅的意思，英气渐渐减退，和初期血战时不同了。
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西宁府循化厅撒拉城的回民军于4月份向清军投降。循化厅在西宁府城东南方一百多里处，这里居住着回民和其他少数民族，历史上称为吐谷浑地。
徐占彪的蜀军于5月份进驻肃州的中和桥。自称兵马大元帅的马文禄，率部占据肃州已有五年。在金积堡覆灭之后，肃州成为西北回民军队的总指挥部。
桂锡桢于6月份领兵攻打肃州东关，攻克回民军的一道大关卡。关外的回民军入城协助防守。徐占彪所部与回民军增援部队在肃州城西南交战，设伏击败回民军。然后进攻塔尔湾，攻破四座堡垒和十九座墩卡。
西宁的回民首领马永福率领米拉回民参见冯邦棅，请求安抚。白彦虎和禹得昌的部队仍在坚固的营垒中抵抗清军。左宗棠派何作霖率领八营部队驻扎在西宁以东两百里处的碾伯，令龙锡庆率两营部队随后跟进。这时刘锦棠从湖南返回甘肃，左宗棠令他率部取道平凉和兰州，奔赴西宁。
7月7日，徐占彪所部攻占塔尔堡，另攻克二十多座小堡。于是，肃州西南马文禄部队的堡墩都被清军扫平。徐占彪所部进驻沙子坝，距离肃州城只有三里。
肃州城内的马文禄部于7月11日大开南门出兵，将士们一律身着白衣，头裹白巾，贴着黄纸。排列好阵式以后，在阵前斩杀一名妇女和一条狗，作为驱魔镇邪的方术，然后开始攻击徐占彪的营垒。
徐占彪关闭垒门，不为所动。等到马文禄所部的中营进入炮火射程，徐占彪才下令用开花炮射击。开花弹落在马文禄所部头上，只听见到处山崩地裂，一片哭喊。
接着，桂锡桢率马队冲入阵内，往来劈砍。马文禄哪里见过这种阵式，连忙下令收兵回城。
从此，徐占彪所部围住肃州城，天天进攻。马文禄哀辞请求安�