留坝、褒城和勉县的太平军于2月份都进入汉中府城。随后，陈得才等人率领二十多万兵力，放弃汉中与兴安，分水陆两路向东开拔。汉水之上，太平军舰船蔽江。陆路上，骑兵和步兵扬起漫天尘沙。
为了应对太平军的这一突然转移，多隆阿派骑兵防守西安。刘蓉的顾虑完全打消了，连忙率部向汉中推进。
太平军乘船从汉水东下，然后弃舟登陆，奔赴镇安、山阳和商南，步兵、骑兵、骆驼队和驿站，接连不断，十来天才走完。
占据洋县的顺天军也全部北进，防守周至，增修栅墙和壕沟，在城内坚守，其余部队有时从佛坪向甘肃运动。
刘蓉于2月18日率部进入汉中府城，满目尸骨纵横，不由恸哭失声，命人全部收棺入殓，由官府派人掩埋。同时上奏，请求免去丁粮，抚恤忠烈，给百姓贷发耕牛和种子，以收人心。
湘军又于2月23日进占城固。兴安和汉中所辖各县，都有湘军进驻。
刘厚基因战功卓著，被清廷授予提督衔。
接下来，刘蓉开始部署兵力。他留下何胜必等人的部队，分别驻扎汉中和兴安，派刘岳昭所部四千五百人返回四川。刘蓉甚至提出派兵助攻周至。多隆阿听了很不高兴，认为他的兵力完全可以攻破周至，无须刘蓉插手，叫他撤回增援部队。
多隆阿不要援兵，自有他的道理。周至是一座小城，守城的起义军兵力不多，但是工事非常坚固。用大部队去攻打，完全没有必要。他的谋士们说，攻克这座城市不用烦劳大将出动，只要围个水泄不通，等到起义军粮食断绝，自然会突围而出，到那时将他们歼灭，可谓易如反掌。txt电子书分享平台
1864年，同治三年（5）
多隆阿已经派出部队前往甘肃攻击回民起义军，但他担心顺天军从后面攻击，所以围住周至，以保援军的安全。这是多隆阿一贯坚持的谨慎布局的谋略。但是清廷的大臣们并不明白前线的情况，也不尊重多隆阿的用兵风格，一味地催促他早日攻克周至。多隆阿为此十分郁闷。
多隆阿虽有内秀，却不喜欢文官的作派。也许这正是他的致命弱点。如果他能像胡林翼、曾国藩和左宗棠一样，把自己的用兵谋略向清廷条分缕析，理直气壮地坚持自己的主张，很可能就会得到清廷的嘉许，而不至于被西太后与那帮大臣们催促得喘不过气来了。
在新年到来后，清廷把李世忠的命运交给曾国藩决定。僧格林沁奏请清廷派李世忠所部到江南攻击太平军，清廷批给曾国藩决断。
李世忠自己也表现得非常顺从，于2月8日向两江总督递交公文，请总督派兵接收他的部队防守的六座城池，即滁州、五河、来安、全椒、天长与六合。他的部队，包括他亲信的豫胜营，可以撤消，也可以调防长江以南，惟总督之命是从。他还要求遣散水师，将船和炮都交给官府。
曾国藩的回答是：部众全部解散，是最好的办法。即便留用，军官不得超过一百名，勇丁不得超过两千人。
苗沛霖和李世忠这两个称霸淮上的军阀退出了舞台，唐训方开始有所作为。他一一安抚各个圩寨，收缴民间的武器，上奏请求转移巡抚衙门，坐镇下蔡，在雉河集增修涡阳县城，想要大干一番，治理好安徽。
但是，这个湖南常宁人并没有更多展示才华的机会。不久，他就因富明阿上次的弹劾而被降了官职，调到别的地方，乔松年代为巡抚。淮甸无事，不用湘军作战了，很有些鸟尽弓藏的意味。
不过，他在1854年还是一个八品教谕，从军八年，就当上了巡抚，虽然从此一蹶不振，毕竟也风光了一回。
李世贤的部队从安徽、福建和浙江进入江西，遭到席宝田等部的阻击。2月16日，席宝田率部猛攻江西东部的金溪，边晓棠担任中路攻击，于2月19日攻克金溪城。李世贤率部从泸溪奔向建昌，江西的驻防军在万年桥将太平军击败。
席宝田和边晓棠率领精毅营北上，于2月27日在婺源的枧桥再次击败太平军。
韩进春的部队在婺源以南作战，在玉山的洋口击败太平军。
河南的捻军在上年底长驱南下，进入新年后攻击湖北的随州和应山。僧格林沁率部从归德以西跟踪而来。官文出城指挥军事，在京山与僧格林沁的部队会师。官文派护军统领舒保率部打前锋，在德安以西遭遇捻军，两军交战，舒保所部大获全胜。然后，舒保的部队对捻军穷追不舍，进入山谷，捻军设伏，发起反攻，将舒保斩杀在战场上。
舒保与多隆阿都是湖北名将，多隆阿坚定沉毅，舒保纯朴实在。湖北一有战事，就把舒保叫出来打仗，湖北没战事了，就把他的部队解散。舒保从来没有摆过自己的战功。舒保的名气仅在多隆阿之下，而他的气数，比起多隆阿来，也是相差无几。
舒保死后，湖北的各路军队士气低落，战事全部依靠僧格林沁的部队。
僧格林沁王爷派头十足，横行霸道，将领们求见，都要先交一百到四百两银子，交银的多少，根据将领们率领的部队多少而定。百姓控诉他的部队奸淫掳掠，他皱着眉头说：“他们离家已久，也难怪他们，你们应该迁移到别处，躲避他们才是。”湖北的百姓大为失望。
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郭松林的湘淮军和戈登的常胜军在3月2日取得重大突破，攻克了太湖西岸的宜兴。湘淮军在江苏、浙江和安徽三省的交界处占据了一个立足之地，并开始攻击宜兴以西的溧阳，在张渚击破李世贤的部队。李世贤撤到溧阳。这里的太平军守将吴人杰不肯接纳，李世贤只得奔向浙江的湖州。
在太湖的西南方，程学启所部仍在加紧围攻嘉兴。太平军则在嘉兴以西的乌镇加紧攻击投降清廷的刘元吉所部。蒋益澧的部将刘树元见乌镇吃紧，于3月4日率部返回乌镇，寻找有利地形渡水，增修两座壁垒。
3月6日，太平军集中兵力攻打刘树元的新垒，投降过来的部队毕竟缺乏底气，首先溃散。刘树元率部在黄昏时突围而出，找不到先前渡水过来的船只，半夜潜行返回，进入已空的壁垒，继续坚守，与太平军相持。何培章和刘元吉两员降将为他供应粮食，太平军一时无法推进。
1864年，同治三年（6）
吴人杰不肯让李世贤进入溧阳城，是因为他已有了向清廷投降的想法。他于3月9日向郭松林投降。湘淮军于3月9日进占溧阳。
3月10日，湘淮军进军金坛，于3月11日在溧阳东北方二十五里处的杨巷打败天国刘王和襄王的部队，向北追逐六十里，直达金坛南门。
常州的太平军将领陈坤书正好从丹徒和句容集结了十多万兵力，环绕常州城北，修筑了几十座堡垒，每天向刘铭传部发起攻击，屡次被湘淮军击退。
攻打乌镇的太平军，由于久攻不克，于3月14日越过乌镇攻打桐乡。蔡元吉领兵出战，将太平军打败。
3月17日，广德州的太平军弃城东奔湖州。自从湘军和湘淮军在苏州、杭州和天京发起攻势以来，左宗棠和他的谋士们，都非常顾忌驻扎在广德的太平军，因为这支部队随时可以对杭州、天京和徽州一带发起攻击。
曾国藩认为湘军兵力不足，暂时不宜发起攻击。但广德一地，总是令湘军大帅们惴惴不安。现在太平军自动撤走，才知道他们并没有多大的能量。曾国藩的谋士们提议让鲍超率部进攻句容。而镇江驻军将领冯子材等人，也出动大量兵力助攻句容和丹阳。
3月22日，蔡元吉所部将太平军追到炉头，蔡元吉冲锋陷阵，手掌中枪断裂。但他继续挥军前进，扫平十座太平军壁垒。
3月23日，太平军前来进攻，湘军又将太平军打退。太平军涌向江阴的南闸。
3月的江南阴雨连绵，降雨二十来天。程学启的心情和天气一样阴沉。他的部队围攻嘉兴，打的是一场恶战，仍然久攻不克。程学启发了狠心，在炮台上坐了三天三晚，亲手发射田鸡炮，击毙大批太平军。黄文金从湖州率部增援廖发，程学启派张家瑜等部将黄文金部击退。
程学启为了早日解决战斗，于3月25日命令部队发炸炮轰城，击毁三面城墙。江福山的水师开进南湖助战。程学启催促将士从缺口登城，只见部队在太平军的火力下大片地倒下。程学启羞愤不已，亲自上阵，越过浮桥，向城上攀登，被子弹击中左额，军士们将他抬回军营。
将领们见程学启如此玩命，都不敢怠慢。潘鼎新、刘秉璋和李朝斌相继率部猛攻，向城内扔火。烈火熊熊，太平军大乱，互相拥挤，牺牲者多达几千名，其中包括两员大将。湘淮军进占嘉兴。
江福山的水师在混战中俘虏了太平军将领，清廷嘉奖江福山，将他以总兵简用。
3月26日，乌镇的太平军听说嘉兴已被湘淮军攻破，担心遭到湘淮军与湘军的夹攻，连忙西撤湖州。
左宗棠早就想对杭州发起第二次总攻，由于有了和平进占杭州的可能，一直按兵未动。
驻守杭州城的天国听王陈炳文，一度打算投降，曾派族兄陈大桂前往苏州请降。李鸿章给左宗棠写信，请他妥为处置。但是陈炳文忽然改变了主意，杀死了杭州城内的内应。左宗棠知道陈大桂提出投降是缓兵之计，便派陈大桂进城，责成陈炳文如约献出杭州城，并且解散部队。但是，城内长久没有回音。
现在，湘淮军已经攻克嘉兴，左宗棠不想再等下去，便令蒋益澧对杭州发起第二次总攻。
3月27日，左宗棠指挥部队猛攻余杭镇，开炮轰城，天国裕王中炮身亡。
仓前的太平军发起猛烈的反攻，从横渡桥包抄湘军，击毙湘军将领蔡盛恩和古捷芳。林珠康和熊飞率部内外冲突，才将仓前的太平军击退。
这时候，余杭镇的太平军已经悄悄将辎重和妇女转移到城外。左宗棠得到哨探的报告，知道太平军将要撤离，令各部严加防备。
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