由于摩萨德的突出贡献，在经过了建国初期情报间谍工作的短暂混乱之后，1951年，本—古里安把维护国家安全、整合国家间谍情报工作的任务委任给了它，而以前摩萨德的主要任务是办理秘密移民。本—古里安还任命了他的好友、被誉为以色列情报专家的罗文·希洛为第一任局长，以表示他对这个机关的信任和重视。
1952年，著名的间谍大事伊赛尔·哈雷尔接替了罗文·希洛，成为以色列情报系统的最高领导人。这位人称“矮个儿伊赛”的大师果然出手不凡，他把大批经过精心训练的优秀间谍派遣到阿拉伯国家执行侦察任务，大力加强对巴勒斯坦间谍组织和苏联外情报官的防范和反间谍工作。在他的领导下，摩萨德得到了完善和发展，成为了保障以色列国家安全不可缺少的“大卫耳目”，因此，一般人都认为哈雷尔是现代摩萨德的奠基人。
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摩萨德的内幕（1）
由于摩萨德直接对总理负责，有特殊的法律加以保护，因此它的组织机构和活动情况相当严密，外界披露甚少，就连历任头目的姓名也被列为最高机密。利他们通常要在退休多年后，才能公开其旧身份。摩萨德要求它的每一名成员都要具结保证，日后不得以任何方式泄露其在摩萨德的经历。
虽然摩萨德的大部分活动都不为人知，但就媒体公开的部分，也能对其内幕窥知一二。
因为承担着艰巨而重大的任务，所以摩萨德具有非常高的地位。它的首脑由以色列总理直接任命，无须经过议会批准，而且基本上获得任命的都是总理的心腹，并只对总理一人负责；摩萨德的首脑每周一次例行向总理汇报工作，是以色列内阁中唯一有权不经通报就可以直接晋见总理的“特殊阁员”。
摩萨德的活动经费完全由内阁负责，它根本不需要因为钱的问题而去同财政部门打交道。当然，花费大笔的金钱，政府也要十分像样的回报的。不过，以色列国力有限，不可能维持庞大的情报机构支出。因此，摩萨德组建了相当精干的特工队伍，而精干、高效也正是摩萨德的最大特点。
在以色列特拉维夫市南端海滨，有一座很不起眼的陈旧的棕褐色小楼，这就是大名鼎鼎的摩萨德总部。摩萨德总部的工作人员约2000人左右，设有九个处。这九个处分别是：
协调、计划行动处，该处的任务是负责策划、决定行动方案和有关的协调事务，具体的行动任务也大多由该处来执行；
情报搜集处，负责通过各种渠道搜集秘密情报；
政治行动与联络处，该处的主要任务是同外国情报机关进行协调，建立合作关系；
人力、财务、安全事务处；
训练、组织事务处；
调查处；
战术行动处；
技术事务处；
派遣、装备处；
摩萨德还有200多名精悍的突击队员专门从事绑架、暗杀、破坏和营救等特别行动。
另外，根据消息灵通的西方情报界人士估计，摩萨德有大约2500—3000名专职或兼职的特工人员活动在以色列以外的世界各地，他们的公开身份是外交官、新闻记者、技术专家、巨富商贾、馆店服务员、酒吧跑堂、秘书、司机甚至妓女；他们一般都经过严格的特别训练，在情报搜集、窃听、爆破、袭击、谋杀行动等方面身怀绝技，具有极强的间谍工作能力。
摩萨德利用高技术进行情报搜集，其水平之高，全球难有与其并肩者。早在摩萨德成立之初，就根据犹太物理学家奈蔓的建议，将它从阿拉伯国家搞到的数量庞大的情报输入并储存在电脑中，从而使以色列情报机关成为世界上第一个使用电子计算机情报机关。凭借这种情报优势，以色列知己知彼，在1956年的第二次中东战争取得了胜利。
美国白宫堪称壁垒森严，但对以色列电脑高手来说，钻进去也只是小菜一碟。摩萨德的“飞箭”特工队，目标是所有外国的机要部门。他们放言：世界上没有一个国家的使领馆“飞箭”不曾光顾过，白宫也不在话下。美国白宫、国务院的电话，甚至克林顿总统的电子邮件，摩萨德均能获取。
据说，摩萨德还掌握了克林顿与莱温斯基长达30个小时情意绵绵的电话录音，并曾想以此要挟克林顿。在1998年斯塔尔向美国国会提交的对克林顿性丑闻的调查报告中，人们大多忽视了这样一段话：莱温斯基说，1997年3月29日，他和克林顿在总统办公室拥抱时，克林顿对她说，他怀疑某国使馆一直在窃听他的电话。克林顿还对她说，如果有人问电话调情如何解释，就说他们为防范窃听，将计就计，用调情来迷惑对方。
而美国联邦调查局对这一段话高度警觉。当即跟踪一位在美国电话公司工作的以色列人，他的妻子是以色列使馆外交官，据说是摩萨德官员。特工搜查他时，发现了一份联邦调查局最敏感的电话号码清单，非常吃惊。美国国家安全委员会反情报部前主任梅杰称，以色列人搞情报就像打仗，永远处于战争状态，而且不惜任何手段。
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摩萨德的内幕（2）
白宫和以色列对此都矢口否认，称摩萨德早有规定，不准在美国从事非法谍报行动。但是从摩萨德所一贯奉行的为了国家利益，没有什么不能干的最高准则来看，很难说这个规定能起多大作用；而且，谁又能完全说清楚合法、非法的界限呢？更何况早在1985年，美国联邦调查局就曾挖出了打入美国海军情报部门的犹太间谍波拉德；还有摩萨德的特工透露，以色列首次对美国总统下手是1974年，目的是了解美国向沙特出售预警飞机的情况。
近年来，网络技术广泛使用，更给电脑高手云集的以色列提供了方便。世上许多“资深”黑客都是以色列人，尽管白宫自称其电脑系统壁垒森严，但如果摩萨德真的想钻进去，恐怕十有###都会干成。几年前，美国最大的电讯集团NORTEL和其下属的TELRAD公司中标获得一个3300万美元的合同，为以色列空军更新电子通讯系统，以方人员也由此可以进入两家公司有关元器件的生产领域，而TELRAD公司又是开发白宫通讯系统的承包者。有分析人士分析，这是以色列特工动手的好机会，他们在供白宫通讯系统使用的元器件中巧妙地埋入了难以发现的间谍芯片。系统投入使用后，美国总统对国家机要部门的指示都被完全复制，通过设在华盛顿的一个以色列计算中心源源不断地传输到摩萨德在特拉维夫的总部，每周多达2至3次！
据说，摩萨德总部内有一幅100多英尺长，由计算机控制的壁式地图，以色列的敌人在全世界各个角落的活动，都能以一个个亮点的形式在这块地图上显示出来。
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摩萨德的训练与工作方式（1）
摩萨德的高效率是建立在大量的高素质特工基础上的，为了培养大批的高素质的特工，摩萨德开发出了一套独特的特工招募和训练模式。
摩萨德采用的成员招募办法是非同一般的，其独特性虽然有时迹近荒唐，但是行之有效。摩萨德的成员之所以能人人都精明强干、师出必成，原因就在于它所招募的人几乎个个都是“间谍天才”。
摩萨德招募人员的挑选工作是由一批被称作“波拉松”的专家进行的。他们经常在商店、俱乐部等公共场所观察和物色；有时还到不同国家或通过第三方招募人选。一旦观察对象被确认适合发展，就由专门负责这项工作的人员想方设法去接近他。当然，这项工作需要极大的耐心和勇气才能有成果。
摩萨德录用间谍没有固定的模式，那些长相、举止都很一般的人往往更容易被录用。如果一个人被看中，并声明愿意为国家做“特殊工作”，他就有可能作为“预选人员”接受进一步的审查。审查的内容包括：与阿拉伯人有没有特殊关系？只有通过了这些审查的人，才可能被允许参加为期一年的训练。
在这一年的开头几个月，被招募人员接受的是情报工作的基础训练，与其他国家对新间谍的训练没有什么差别，包括使用各种枪支和器械、运用密码、练习柔道、格斗等技术。除此之外，被招募人员接受的是摩萨德特有的专门训练，如：用羽毛中装有电子发射装置的信鸽来进行空中侦察；操纵在机身中装备有电视摄像机的航空模型飞机，搜索巴勒斯坦解放组织训练营地的情况等。
在这些专业训练中，“最让人伤脑筋的是连续不断的记忆训练，”一个被淘汰的被招募人员在事后回忆说：“给我们放了一部电影，突然，放映机停止，教官马上让我们详细地讲述刚才看见的一切，比如，请立即说出刚才画面中出现的20件东西是什么以及它们的形状和颜色。”通过这种训练，可以在很短的时间里提高特工们对图纸、文件、照片的记忆力。
被招募人员还要练习如何进行跟踪而不被发现，或让别人跟踪自己，再如何甩掉“尾巴”。如果学员轻松的完成任务，教管就会派出更有经验的对手以增加训练的难度。
经过6个月的训练考察后，大约三分之一的不合格者被淘汰出局，他们不是自动放弃，就是被教官劝退了。
在最后的半年里，剩下的学员将接受更为全面的训练，使他们能更适应派往国家的生活环境。首先，他们必须掌握派往国的语言，并从外表上看与当地人没有明显的区别。摩萨德招募成员的一个极为有利的条件就是以色列人的多国家性，在来自世界各地的犹太移民中，它可以轻而易举地挑选到熟悉所在国情况的间谍人才，等等。例如，从来自德国的犹太人中，招募到一个会说地道德语的间谍就十分容易；同样，在来自世界各地的犹太移民中，摩萨德可以招募到大批熟悉所在国情况的间谍人才。
训练的最后一个阶段是适应间谍生活的关键时刻。在这段时