1925年3月12日，孙中山在北京与世长辞。1926年8月17日，国立广东大学易名为国立中山大学，作为对孙中山永远的纪念。
三校并立成中山
追溯起来，中山大学是以国立广东高等师范、广东法科大学和广东农业专门学校为基础建立的。
国立广东高等师范学校始建于光绪三十一年（1905年）。最初是两广速成师范馆，然后改为初级师范简易科，又改为两广师范学堂。第二年改为两广优级师范学堂，设文学、史舆、数理化、博物四科，四年毕业。并附设体育专修科及小学。1912年2月，改为国立广东高等师范学校。1915年增设图工体乐专修科，1921年附设国语传习所，并于文史、英语、数理化、博物四部外，增设社会科学部。1923年12月，邹鲁任国立广东高等师范学校校长。1924年1月，改组后的中国国民党第一次全国代表大会就是在国立广东高等师范学校大礼堂举行的。此后，孙中山先生每周在高师大礼堂作新三民主义的演讲。广东公立法科大学可追溯到1905年广东课吏馆的创立，后改为广东法政学堂。1912年改为广东公立法政专门学校，分设法律、政治、经济等科。1923年8月改为法科大学。广东公立农业专门学校源于宣统元年（1909年）广东农林试验场的创立，1917年改为广东公立农业专门学校。
国立广东大学成立后，高师被改编为国立广东大学的文科和理科，法大被改编为法科，农专改编为农科，另外再组建工科和预科，后又设置了师范科。1925年7月，广东公立医科大学（源于1909年创立的公立医学校，1915年改名广东公立医科专门学校，1924年8月改称广东医科大学）归并国立广东大学，成为医科。1924年9月，国立广东大学正式开始上课，首次招收预科学生372名。
民国政府支持下的发展
1927年3月，中山大学举行开学典礼。7月，改称国立第一中山大学。1928年又改称国立中山大学。到1931年，中山大学设有文、法、理、农、医五个学科。
1931年6月，许崇清担任中山大学校长，随即对学校的体制进行了改革，实行了学院制。将文科改为文学院、法科改为法学院、理科改为理工学院、农科改为农学院、医科改为医学院，实行校、院、系（医学院不设系）三级管理体制。同时增设了三个学系，文学院增设社会学系，理工学院增设土木工程系和化学工程系两个工科学系，为后来工学院的设立打下了良好的基础。
1932年2月，邹鲁第二次执掌国立中山大学。上任伊始，邹鲁一方面着手筹建国立中山大学石牌校区，一方面大力延揽人才，聘用大批知名学者来校任教。1933年秋，农学院、工学院、法学院率先迁入新校址开学上课。1935秋，除医学院及附属医院、附中、附小外，学校全部迁入了石牌新校址。1934年，增设工学院。1935年6月，国立中山大学研究院成立，这是中山大学居于全国名牌大学前沿的标志，当时经###核准成立研究院的国立大学全国仅有三所（其余两所为清华大学、北京大学）。
1937年，中山大学已经发展为拥有文、理、法、工、农、医、师范7个学院和1个研究院的综合性大学。许多大家学者曾经在这里任教，如郭沫若、鲁迅、郁达夫、成仿吾、王独清、云常湄等。
在战火中成长
1937年，抗日战争开始。1938年10月，中山大学迁往广东罗定，1939年2月又迁至云南澄江。1940年，滇南物价暴涨，生活极为艰辛，中山大学于是年12月迁到广东坪石。此时，许崇清第二次执掌国立中山大学。由于坪石只是广东省的一个边陲小镇，所以学校只能分散在坪石及周边地区：文、理、工三学院分设于坪石附近之铁岭、塘口、三星坪等地；又增设一年级教育委员会于车田坝；医学院设于乐昌县城；法学院设于武阳司；师范学院设于管埠；农学院则设在湖南宜章县的栗源堡。此间，许崇清大力提倡学术研究，聘请了包括哲学家李达、文俗学家钟敬文、经济学家王亚南、法学家梅龚彬、戏剧家洪深等在内的一批著名学者，推动了学校的发展。1945年初，中山大学又迁到东江、连县等地坚持办学。9月，抗战胜利，中山大学回迁广州石牌。
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中山大学（2）
返回广州后，中山大学师范学院改制，将所属国文、英语、史地理化、博物、数学各系分别合并于文、理两学院相关系别，仅留教育学系，并新设体育学系。1946年7月，各学院所属文科、师范、农科及医科各研究所，分由文学院、师范学院、农学院、医学院兼办。同时，改文学院中国语言文学系为中国文学系、语言学系；理学院数学天文系为数学系、天文学系；文学院文科研究所为中国语言文学研究所暨历史学研究所；师范学院研究所为教育学研究所；农学院农林植物研究所为土壤学研究所；原有农林植物学部改称植物研究所；医学院研究所改为病理学研究所。学校的研究机构日趋完备。
1949年，当局欲将中山大学迁到海南岛，遭到了广大师生员工的反对，并为保护校产进行了护校斗争。1949年10月，广州解放，中山大学得到了新生。
岭南大学
在现中山大学的形成中，还有一所大学需要提及，它就是近代著名的岭南大学。岭南大学的前身格致书院是一所由外国人创办的教会学堂。对于从美国教会手中收回岭南大学，有一个人可谓功不可没。他就是被称为“岭大之父”的钟荣光。
钟荣光（1866年—1942年），别字惺可，是我国著名教育家、岭南大学第一任华人校长。1899年，钟荣光应邀担任格致书院国文总教习。1900年，书院迁往澳门，更名为岭南学堂。1902年10月18日，时任岭南学堂副监督的钟荣光开始在广州河南康乐村购地建校。1904年，岭南学堂从澳门迁入康乐园。钟荣光从此开始了他以岭南为家的生活。1912年，学堂更名为岭南学校；1918年又改为岭南大学。
钟荣光目睹了近百年来帝国主义对中国的侵略，很早就有收回帝国主义在中国的教育权，中国学校由中国人自办的主张。在他的不懈努力下，1927年8月，学校主权终于全部收回，更名为私立岭南大学，由钟荣光任校长，成为中国第一所由外国教会设立而收归华人自办的大学。
岭南大学原来只有文理学院。钟荣光接任校长后，先后增设了农学院、工学院、商学院，以及医学院、神学院，使岭南大学拥有6个学院30个系，成为南中国规模较大的综合性大学。校园建设上也是日新月异。1928年10月，科学院大楼落成并投入使用；1929年12月，由钟荣光筹集资金的农业教学楼（十友堂）竣工投入使用；同时，土木工程学院的工程大楼也破土动工。这一系列建筑工程的完成，标志着岭南大学办学规模的不断扩大。另外，钟荣光大力扩建医学教育。1928年，他接管了创办于1826年的博济医院，并于1936年以此为基础成立了孙逸仙博士医学院（后中山医科大学的前身之一）。医学院共有5个系：解剖系、物理学系、细菌学系、药理学系、公共医疗系。在钟荣光的努力下，岭南大学不仅成为当时广东最美丽的花园式学校，而且是主要靠中国人自己建设起来的华南第一所大学。
新中国的重点大学
新中国成立后，中山大学的建设受到高度重视。1952年，全国大学院系调整。工、农、医、师范等4个学院从中山大学划出，文理学科则搬至康乐园与岭南大学合并，组建了新的中山大学，成为一所以文理科为基础的综合性大学。
1953年，中山大学医学院调出与岭南大学医学院组成华南医学院，1954年广东光华医学院并入。此后，华南医学院先后改名为广州医学院、中山医学院。1985年，更名中山医科大学，并逐步发展成为一所多学院的医科大学，在医学遗传学、眼科学、肿瘤学、寄生虫学、内科肾脏病学、器官移植、传染性肝病、生物医学工程及分子医学等方面科学研究成绩显著。
作为全国重点大学，中山大学也是我国首批博士、硕士学位授予单位和建立首批博士后科研流动站的单位之一。20世纪90年代，中山大学率先在华南地区设立第一所研究生院，建立了完整的学士、硕士、博士培养体系。
2000年9月，中山大学珠海校区建成。2001年10月，中山大学与中山医科大学合并，组成新的中山大学。两所有着深厚历史渊源的大学合并，无疑为中山大学更进一步的发展提供了机遇，使得中山大学学科设置更加齐全，办学力量更为壮大。2004年9月，中山大学东校区在广州市的番禺区正式落成，进一步拓展了办学空间。
国际影响
中山大学对外学术交流很活跃，迄今为止，已与美国、加拿大、日本、澳大利亚、英国、法国、德国等国家和地区的100多所著名大学、学术机构和团体建立了学术交流关系，并与其中的40多所签署了交流协议。
师资力量
中山大学有着雄厚的师资力量，全校共有教职工近12000人，其中博士生导师663人，具有高级职称的850多人，具有副高职称的1500人。教师队伍中杰出人才辈出，有中国科学院院士13人、中国工程院院士4人，国家级教学名师2人，国家级有突出贡献的中青年专家15人，国家杰出青年科学基金获得者37人，国家人事部“百千万人才工程”第一、二层次人选19人，###“跨世纪优秀人才培养计划”人选19人，###“长江学者奖励计划”特聘教授16人，卫生部突出贡献专家16人、霍英东青年教师基金获得者15人、霍英东青年教师奖获得者18人。
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中山大学（3）
著名系科
学校有89个本科专业、32个硕士学位授权一级学科、22个博士学位授权一级学科，博士学�